28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8006 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_8006  OsmC family protein  100 
 
 
134 aa  272  1.0000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7915  redox protein regulator of disulfide bond formation-like protein  62.88 
 
 
138 aa  160  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2694  OsmC family protein  58.91 
 
 
130 aa  149  8.999999999999999e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0448513  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20740  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  40.46 
 
 
131 aa  81.6  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.104919  normal  0.0981692 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2692  OsmC family protein  36.36 
 
 
161 aa  78.6  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0751564  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14900  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  34.85 
 
 
152 aa  73.2  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0136594  normal  0.328629 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0710  OsmC family protein  34.85 
 
 
154 aa  72  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1570  OsmC family protein  35.88 
 
 
145 aa  62  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00295172  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12938  hypothetical protein  29.55 
 
 
137 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0241589  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1983  OsmC family protein  30.95 
 
 
146 aa  56.6  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2855  OsmC family protein  31.78 
 
 
158 aa  55.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.404527 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1931  OsmC family protein  30.88 
 
 
141 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.110591  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1951  OsmC-like protein  30.15 
 
 
141 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.466899  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1997  OsmC family protein  30.15 
 
 
141 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.608934  normal  0.376979 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2074  OsmC family protein  30.08 
 
 
153 aa  52  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.12637  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4190  OsmC family protein  31.82 
 
 
163 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.708913  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2173  OsmC family protein  31.82 
 
 
141 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30670  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  29.32 
 
 
171 aa  49.7  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0784  OsmC family protein  25.95 
 
 
154 aa  48.1  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0403  OsmC-like protein  27.82 
 
 
139 aa  47.4  0.00007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06689  hypothetical protein  23.2 
 
 
136 aa  43.5  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1018  OsmC family protein  38.17 
 
 
142 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000792  OsmC/Ohr family protein  25 
 
 
132 aa  42.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2351  OsmC family protein  25.2 
 
 
145 aa  42.7  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0541  OsmC family protein  34.29 
 
 
151 aa  42.4  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.489752  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49110  redox protein  35.09 
 
 
153 aa  42  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.22028  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2839  OsmC family protein  25.41 
 
 
164 aa  41.6  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.23594  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1495  OsmC family protein  24.6 
 
 
141 aa  41.2  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>