45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6205 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6205  hypothetical protein  100 
 
 		 372 aa  759    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.454836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2452  hypothetical protein  46.61 
 
 		 384 aa  305  7e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000678716  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4070  hypothetical protein  47.68 
 
 		 365 aa  298  1e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0178352  normal  0.419833 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5370  hypothetical protein  47.28 
 
 		 371 aa  271  2e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.861425 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5325  hypothetical protein  45.79 
 
 		 365 aa  270  2e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2792  hypothetical protein  42.9 
 
 		 362 aa  263  4e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0226993  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4984  hypothetical protein  41.42 
 
 		 373 aa  260  3e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.405454  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3510  hypothetical protein  41.6 
 
 		 404 aa  236  7e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0541422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7635  hypothetical protein  41.37 
 
 		 363 aa  235  9e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.678328 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3523  hypothetical protein  40.81 
 
 		 375 aa  229  4e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3370  hypothetical protein  39.12 
 
 		 368 aa  226  6e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.357323 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3488  hypothetical protein  39.67 
 
 		 355 aa  226  6e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5461  hypothetical protein  37.33 
 
 		 367 aa  223  3e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.898004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5246  hypothetical protein  40.39 
 
 		 366 aa  218  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.422141 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4303  hypothetical protein  39.18 
 
 		 374 aa  210  3e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4281  hypothetical protein  39.18 
 
 		 374 aa  207  3e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.355185  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4736  hypothetical protein  38.15 
 
 		 366 aa  207  3e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.968842 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2728  hypothetical protein  36.19 
 
 		 367 aa  206  4e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.683635  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4150  hypothetical protein  38.08 
 
 		 374 aa  206  8e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3484  hypothetical protein  34.41 
 
 		 422 aa  193  5e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0975  hypothetical protein  37.47 
 
 		 377 aa  189  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0164  hypothetical protein  33.8 
 
 		 355 aa  168  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2067  hypothetical protein  33.24 
 
 		 379 aa  146  5e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0357547 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0286  hypothetical protein  32.81 
 
 		 375 aa  119  6e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.513722 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0019  hypothetical protein  30.24 
 
 		 389 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3435  protein of unknown function DUF1006  30.95 
 
 		 382 aa  109  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1792  hypothetical protein  29.89 
 
 		 377 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5001  hypothetical protein  25.47 
 
 		 352 aa  73.9  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0712295  normal  0.0100104 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0441  hypothetical protein  26.61 
 
 		 373 aa  68.6  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.22704 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1894  hypothetical protein  26.43 
 
 		 367 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3338  hypothetical protein  26.87 
 
 		 395 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6013  hypothetical protein  28.22 
 
 		 342 aa  60.1  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.994195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6445  hypothetical protein  23.82 
 
 		 412 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0946516  normal  0.0409741 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3022  hypothetical protein  24.73 
 
 		 395 aa  52  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.628375  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0283  hypothetical protein  21.53 
 
 		 367 aa  50.4  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4094  hypothetical protein  24.93 
 
 		 389 aa  50.8  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1325  hypothetical protein  25.68 
 
 		 383 aa  49.7  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.397251  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1330  hypothetical protein  27.83 
 
 		 353 aa  48.9  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.789559  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4328  hypothetical protein  26.35 
 
 		 353 aa  48.1  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0822537 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3454  hypothetical protein  30.27 
 
 		 396 aa  47  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.863709  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1484  hypothetical protein  28.65 
 
 		 378 aa  45.8  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0801709  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5273  hypothetical protein  24.2 
 
 		 357 aa  44.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0878  hypothetical protein  20.54 
 
 		 357 aa  45.1  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1142  hypothetical protein  21.51 
 
 		 372 aa  44.7  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.561604  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0405  hypothetical protein  29.89 
 
 		 394 aa  43.9  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.499307  normal  0.272447 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>