14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3632 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3632  hypothetical protein  100 
 
 
121 aa  244  4e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.212692  normal  0.177442 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0322  hypothetical protein  73.11 
 
 
127 aa  183  7e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3309  peroxiredoxins-like  72.88 
 
 
192 aa  182  1.0000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.268987  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3827  hypothetical protein  55.17 
 
 
123 aa  127  4.0000000000000003e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.526399  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0352  hypothetical protein  32.65 
 
 
119 aa  56.2  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1216  hypothetical protein  29.41 
 
 
120 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000317596  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0031  DsrE family protein  32.67 
 
 
121 aa  56.2  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4889  hypothetical protein  36.19 
 
 
121 aa  55.5  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.254553 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0663  DsrE family protein  28 
 
 
118 aa  54.3  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.800097  normal  0.0161354 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0884  DsrE family protein  33.33 
 
 
117 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2605  DsrE family protein  30.51 
 
 
122 aa  50.8  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.661009  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1830  DsrE family protein  28.85 
 
 
121 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.169192 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1655  DsrE family protein  27 
 
 
120 aa  40.8  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.171816 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1006  hypothetical protein  24.14 
 
 
122 aa  40.8  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.966522  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>