More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3454 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2150  pyoverdine sidechain peptide synthetase IV, D-Asp-L-Ser component  38.8 
 
 
2875 aa  702    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2859  peptide synthase  40.83 
 
 
4991 aa  659    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1859  amino acid adenylation domain-containing protein  40 
 
 
2596 aa  661    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2420  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  38.51 
 
 
1839 aa  699    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452144  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3454  amino acid adenylation domain protein  100 
 
 
1339 aa  2632    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0624608  decreased coverage  0.0000000205264 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1960  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  39.23 
 
 
2883 aa  693    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.77716 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5618  amino acid adenylation domain-containing protein  36.61 
 
 
2156 aa  674    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2874  non-ribosomal peptide synthase  36.96 
 
 
2156 aa  681    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4085  amino acid adenylation domain-containing protein  41.45 
 
 
2606 aa  705    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2462  linear gramicidin synthetase subunit D  36.93 
 
 
2156 aa  688    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1845  peptide synthase  41.23 
 
 
5654 aa  733    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1829  amino acid adenylation  41.81 
 
 
4037 aa  716    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4039  amino acid adenylation domain-containing protein  41.51 
 
 
3224 aa  653    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25570  peptide synthase  41.87 
 
 
5213 aa  707    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1676  amino acid adenylation domain-containing protein  41.6 
 
 
3432 aa  691    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.602072 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4072  amino acid adenylation domain protein  41.8 
 
 
3230 aa  644    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.753138 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5075  amino acid adenylation domain protein  38.12 
 
 
1769 aa  694    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944137  normal  0.714561 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0525  non-ribosomal peptide synthase  40.85 
 
 
3180 aa  633  1e-180  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3091  amino acid adenylation domain protein  34.78 
 
 
1870 aa  628  1e-178  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5871  amino acid adenylation domain protein  33.24 
 
 
1078 aa  626  1e-178  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.126486 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3030  amino acid adenylation domain protein  34.89 
 
 
1870 aa  625  1e-177  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6558  non-ribosomal peptide synthase  43.1 
 
 
4106 aa  620  1e-176  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138815 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1866  amino acid adenylation  41.88 
 
 
1074 aa  619  1e-175  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.996538  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1089  putative non-ribosomal peptide synthase  38.82 
 
 
5467 aa  610  1e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.993162 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1875  amino acid adenylation domain-containing protein  37.51 
 
 
1990 aa  610  1e-173  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5752  amino acid adenylation domain protein  34.93 
 
 
1069 aa  612  1e-173  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1160  amino acid adenylation  41.11 
 
 
3231 aa  609  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1640  amino acid adenylation domain-containing protein  41.11 
 
 
3231 aa  609  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1942  putative siderophore non-ribosomal peptide synthetase MbaJ  41.79 
 
 
3290 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1598  amino acid adenylation domain-containing protein  41.25 
 
 
3219 aa  605  1.0000000000000001e-171  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00546873 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2086  putative siderophore related no-ribosomal peptide synthase  41.98 
 
 
3287 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0873  putative non-ribosomal peptide synthetase  41.9 
 
 
3294 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1625  putative non-ribosomal peptide synthetase  41.9 
 
 
3297 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0842979  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0288  putative non-ribosomal peptide synthetase  41.9 
 
 
3294 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1927  putative siderophore non-ribosomal peptide synthetase MbaJ  41.98 
 
 
3290 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3094  amino acid adenylation domain protein  32.22 
 
 
3086 aa  601  1e-170  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.54199 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2418  peptide synthetase-like protein  41.03 
 
 
3296 aa  601  1e-170  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11449  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3468  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  40.77 
 
 
7541 aa  598  1e-169  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.247204 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4786  non-ribosomal peptide synthase  41.3 
 
 
3219 aa  595  1e-168  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303001  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3027  amino acid adenylation domain protein  31.97 
 
 
3086 aa  595  1e-168  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1861  amino acid adenylation domain protein  36.14 
 
 
2571 aa  592  1e-167  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  36.1 
 
 
3308 aa  590  1e-167  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1835  amino acid adenylation domain protein  36.14 
 
 
2571 aa  591  1e-167  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  33.33 
 
 
4968 aa  587  1e-166  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1558  amino acid adenylation domain-containing protein  40.95 
 
 
3227 aa  586  1e-166  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.765691 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1615  amino acid adenylation domain-containing protein  41.15 
 
 
3221 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0566356 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5750  amino acid adenylation domain protein  35.26 
 
 
1454 aa  583  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  40.02 
 
 
8646 aa  578  1.0000000000000001e-163  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1674  amino acid adenylation domain-containing protein  36.57 
 
 
5230 aa  579  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2463  bacitracin synthetase 1  33.05 
 
 
4960 aa  579  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1537  amino acid adenylation domain-containing protein  40.82 
 
 
3227 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3743  amino acid adenylation domain protein  38.66 
 
 
2626 aa  575  1.0000000000000001e-162  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  36.65 
 
 
6676 aa  575  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25560  Non-ribosomal peptide synthase, PvdD-like protein  35.36 
 
 
2878 aa  575  1.0000000000000001e-162  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2873  bacitracin synthetase 1  32.97 
 
 
4960 aa  575  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3730  amino acid adenylation domain-containing protein  40.15 
 
 
2651 aa  573  1.0000000000000001e-162  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.390082 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  38.87 
 
 
6889 aa  571  1e-161  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4083  amino acid adenylation domain-containing protein  37.09 
 
 
3942 aa  573  1e-161  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.223479 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1888  amino acid adenylation domain protein  36.72 
 
 
1315 aa  570  1e-161  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0349547  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6813  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase  39.83 
 
 
4383 aa  571  1e-161  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25580  peptide synthase  37.43 
 
 
4747 aa  570  1e-161  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5191  amino acid adenylation domain protein  33.65 
 
 
9175 aa  569  1e-160  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.233499 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  36.77 
 
 
4531 aa  568  1e-160  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2212  amino acid adenylation  39.39 
 
 
5422 aa  568  1e-160  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  35.63 
 
 
4502 aa  565  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2858  peptide synthase  38.24 
 
 
4136 aa  561  1e-158  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1861  amino acid adenylation domain-containing protein  33.59 
 
 
2883 aa  560  1e-158  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4753  amino acid adenylation domain-containing protein  36.5 
 
 
6176 aa  561  1e-158  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.86552 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4518  non-ribosomal peptide synthetase, initiating component  36.13 
 
 
1753 aa  557  1e-157  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  38.19 
 
 
5953 aa  554  1e-156  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2213  amino acid adenylation  37.36 
 
 
4882 aa  555  1e-156  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1748  amino acid adenylation domain protein  36.2 
 
 
7712 aa  553  1e-155  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.970061 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6473  amino acid adenylation domain-containing protein  36.64 
 
 
3018 aa  550  1e-155  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0194792 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33610  peptide synthase  37.65 
 
 
5149 aa  548  1e-154  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.844682 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3129  amino acid adenylation domain-containing protein  31.41 
 
 
1816 aa  548  1e-154  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.975665  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  28.28 
 
 
1833 aa  549  1e-154  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4219  non-ribosomal siderophore peptide synthetase  35.14 
 
 
3470 aa  544  1e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  33.42 
 
 
3432 aa  543  1e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  37.09 
 
 
13537 aa  545  1e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3701  non-ribosomal peptide synthase  34.65 
 
 
3962 aa  543  1e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1887  amino acid adenylation domain protein  38.68 
 
 
2614 aa  544  1e-153  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0695  non-ribosomal peptide synthetase  37.26 
 
 
3291 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.622014  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3346  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  35.37 
 
 
1864 aa  539  1e-151  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0153259 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  36.68 
 
 
9498 aa  538  1e-151  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5189  amino acid adenylation domain protein  31.98 
 
 
6202 aa  537  1e-151  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000018726 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2574  amino acid adenylation domain-containing protein  33.77 
 
 
6404 aa  538  1e-151  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2092  amino acid adenylation domain-containing protein  34.81 
 
 
1661 aa  539  1e-151  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  37.72 
 
 
3176 aa  538  1e-151  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.173269 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7311  peptide synthetase  35.18 
 
 
2183 aa  535  1e-150  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1087  putative non-ribosomal peptide synthase  37.8 
 
 
3235 aa  533  1e-150  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2214  syringomycin synthetase  36.9 
 
 
3348 aa  533  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2569  amino acid adenylation domain-containing protein  33.33 
 
 
2971 aa  535  1e-150  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00188555 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5064  amino acid adenylation domain protein  41.11 
 
 
4449 aa  531  1e-149  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2148  pyoverdine sidechain peptide synthetase II, D-Asp-L-Thr component  33.86 
 
 
2625 aa  530  1e-149  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.307821  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4756  amino acid adenylation domain-containing protein  37.98 
 
 
1789 aa  531  1e-149  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171459  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2149  pyoverdine sidechain peptide synthetase III, L-Thr-L-Ser component  36.46 
 
 
2151 aa  527  1e-148  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4985  amino acid adenylation domain protein  31.12 
 
 
1336 aa  528  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.247998 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  34.28 
 
 
4342 aa  527  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2869  amino acid adenylation domain-containing protein  36.71 
 
 
5328 aa  525  1e-147  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.127211 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  33.39 
 
 
2791 aa  524  1e-147  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0712365 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>