30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0503 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0503    100 
 
 
256 bp  507  9.999999999999999e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00200956  normal  0.0242434 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1219    93.62 
 
 
2912 bp  69.9  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.592075  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4732  Integrase catalytic region  93.62 
 
 
930 bp  69.9  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4701  Integrase catalytic region  93.62 
 
 
930 bp  69.9  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4663  Integrase catalytic region  93.62 
 
 
930 bp  69.9  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3614  Integrase catalytic region  93.62 
 
 
930 bp  69.9  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3430  Integrase catalytic region  93.62 
 
 
930 bp  69.9  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2811  Integrase catalytic region  93.62 
 
 
930 bp  69.9  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.675485  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2615  Integrase catalytic region  93.62 
 
 
930 bp  69.9  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2169  Integrase catalytic region  93.62 
 
 
930 bp  69.9  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.401099  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2167    93.62 
 
 
2989 bp  69.9  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.965332  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1220  Integrase catalytic region  93.62 
 
 
939 bp  69.9  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1224  Integrase catalytic region  93.62 
 
 
939 bp  69.9  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.401317  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2523  Integrase catalytic region  93.62 
 
 
939 bp  69.9  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000011837  hitchhiker  0.000558279 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3705    93.62 
 
 
938 bp  69.9  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00230013  normal  0.692248 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0711    93.62 
 
 
3753 bp  69.9  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2656    82.98 
 
 
2656 bp  52  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4660  Integrase catalytic region  82.98 
 
 
969 bp  52  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0364  Integrase catalytic region  82.98 
 
 
969 bp  52  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0367  Integrase catalytic region  82.98 
 
 
969 bp  52  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2801  Integrase catalytic region  82.98 
 
 
969 bp  52  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0160717  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2658  Integrase catalytic region  82.98 
 
 
969 bp  52  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0737  Integrase catalytic region  82.98 
 
 
969 bp  52  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2588  Integrase catalytic region  82.98 
 
 
969 bp  52  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0712    82.98 
 
 
2569 bp  52  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0714    82.98 
 
 
969 bp  52  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1739  Integrase catalytic region  82.98 
 
 
969 bp  52  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0682469  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1177  Integrase catalytic region  82.98 
 
 
969 bp  52  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1173  Integrase catalytic region  82.98 
 
 
969 bp  52  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0819  Integrase catalytic region  82.98 
 
 
969 bp  52  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>