13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0312 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0312  hypothetical protein  100 
 
 		 101 aa  202  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2034  hypothetical protein  38.71 
 
 		 91 aa  54.7  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.81797  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1931  TfoX domain protein  40 
 
 		 84 aa  48.9  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0302  hypothetical protein  34.78 
 
 		 84 aa  46.2  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.516262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1325  hypothetical protein  32.79 
 
 		 195 aa  46.6  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0134682  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003942  DNA transformation protein TfoX  31.15 
 
 		 187 aa  45.4  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01580  hypothetical protein  31.15 
 
 		 196 aa  45.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1766  TfoX domain-containing protein  30.77 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3473  regulator of competence-specific genes  31.51 
 
 		 217 aa  42  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2346  TfoX family regulatory protein  34.18 
 
 		 92 aa  42  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.11601  normal  0.77091 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03141  TfoX C-terminal domain family  35.62 
 
 		 127 aa  42  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1982  putative DNA transformation protein TfoX  27.03 
 
 		 195 aa  41.2  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.42956  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4795  TfoX-like  32 
 
 		 90 aa  41.2  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150833  unclonable  0.0000206045 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>