33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0077 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0077  hypothetical protein  100 
 
 
198 aa  391  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0127  hypothetical protein  66.67 
 
 
187 aa  224  7e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5273  Protein of unknown function DUF2587  66.11 
 
 
181 aa  215  4e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.281014  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0071  hypothetical protein  77.24 
 
 
186 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.254747  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0135  hypothetical protein  68.28 
 
 
182 aa  213  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1187  hypothetical protein  62.37 
 
 
173 aa  210  1e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.396204  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0075  hypothetical protein  68.82 
 
 
179 aa  209  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.617604  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5078  hypothetical protein  63.1 
 
 
172 aa  209  3e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.959015 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5371  hypothetical protein  63.1 
 
 
172 aa  209  3e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4990  hypothetical protein  63.1 
 
 
172 aa  209  3e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5617  hypothetical protein  75.34 
 
 
169 aa  207  6e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.47308  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0279  Protein of unknown function DUF2587  64.67 
 
 
182 aa  207  7e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0633676  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4099  Protein of unknown function DUF2587  66.47 
 
 
169 aa  207  1e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2102  hypothetical protein  67.44 
 
 
176 aa  206  2e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.590886 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0179  hypothetical protein  67.06 
 
 
192 aa  203  2e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.412757  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13814  hypothetical protein  69.74 
 
 
178 aa  203  2e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.482077 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0145  hypothetical protein  70.51 
 
 
169 aa  202  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.266352  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01600  Protein of unknown function (DUF2587)  60.11 
 
 
183 aa  202  4e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.620964  normal  0.0409014 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0287  hypothetical protein  73.47 
 
 
210 aa  200  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0288  hypothetical protein  64.2 
 
 
184 aa  197  7.999999999999999e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4526  hypothetical protein  60.1 
 
 
205 aa  197  7.999999999999999e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.99956 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0288  Protein of unknown function DUF2587  80.16 
 
 
184 aa  195  3e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5036  hypothetical protein  63.69 
 
 
205 aa  192  3e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0482464 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0384  hypothetical protein  63.06 
 
 
189 aa  192  4e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0808984  normal  0.841942 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4321  hypothetical protein  69.74 
 
 
190 aa  191  6e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0109  hypothetical protein  69.33 
 
 
205 aa  177  8e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.479318  normal  0.676341 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3178  Protein of unknown function DUF2587  70.2 
 
 
199 aa  169  3e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.047355 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0683  hypothetical protein  62.25 
 
 
207 aa  169  3e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.457589  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0833  hypothetical protein  57.67 
 
 
215 aa  166  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.568617 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0259  hypothetical protein  67.53 
 
 
204 aa  164  8e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105834 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01780  Protein of unknown function (DUF2587)  65.47 
 
 
165 aa  153  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.811908  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1197  hypothetical protein  55.24 
 
 
158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.127086  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0169  hypothetical protein  71.88 
 
 
209 aa  139  3.9999999999999997e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.804249  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>