33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5273 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014211  Ndas_5273  Protein of unknown function DUF2587  100 
 
 
181 aa  356  9.999999999999999e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.281014  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0127  hypothetical protein  66.31 
 
 
187 aa  225  3e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0071  hypothetical protein  78 
 
 
186 aa  222  2e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.254747  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0145  hypothetical protein  68.33 
 
 
169 aa  220  7e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.266352  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0077  hypothetical protein  66.11 
 
 
198 aa  215  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0075  hypothetical protein  71.6 
 
 
179 aa  214  5e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.617604  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5078  hypothetical protein  69.51 
 
 
172 aa  212  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.959015 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5371  hypothetical protein  69.51 
 
 
172 aa  212  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4990  hypothetical protein  69.51 
 
 
172 aa  212  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0279  Protein of unknown function DUF2587  70.62 
 
 
182 aa  211  2.9999999999999995e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0633676  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1187  hypothetical protein  71.43 
 
 
173 aa  210  1e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.396204  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5617  hypothetical protein  64.13 
 
 
169 aa  209  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.47308  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13814  hypothetical protein  68.99 
 
 
178 aa  209  2e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.482077 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0135  hypothetical protein  71.43 
 
 
182 aa  208  4e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0179  hypothetical protein  76.39 
 
 
192 aa  207  5e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.412757  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2102  hypothetical protein  62.57 
 
 
176 aa  201  6e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.590886 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0288  Protein of unknown function DUF2587  81.15 
 
 
184 aa  198  3.9999999999999996e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4099  Protein of unknown function DUF2587  66.27 
 
 
169 aa  197  6e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01600  Protein of unknown function (DUF2587)  65.58 
 
 
183 aa  195  3e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.620964  normal  0.0409014 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0384  hypothetical protein  64.83 
 
 
189 aa  188  4e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0808984  normal  0.841942 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0288  hypothetical protein  64.2 
 
 
184 aa  187  5e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0287  hypothetical protein  69.59 
 
 
210 aa  187  5e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4526  hypothetical protein  60.87 
 
 
205 aa  186  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.99956 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4321  hypothetical protein  67.79 
 
 
190 aa  184  4e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5036  hypothetical protein  61.93 
 
 
205 aa  184  5e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0482464 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0833  hypothetical protein  53.85 
 
 
215 aa  170  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.568617 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0259  hypothetical protein  79.66 
 
 
204 aa  168  3e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105834 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0683  hypothetical protein  69.35 
 
 
207 aa  168  4e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.457589  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0109  hypothetical protein  58.99 
 
 
205 aa  164  5.9999999999999996e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.479318  normal  0.676341 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3178  Protein of unknown function DUF2587  60 
 
 
199 aa  162  3e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.047355 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0169  hypothetical protein  73.68 
 
 
209 aa  149  2e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.804249  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01780  Protein of unknown function (DUF2587)  58.99 
 
 
165 aa  147  6e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.811908  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1197  hypothetical protein  57.25 
 
 
158 aa  144  1e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.127086  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>