33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0384 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0384  hypothetical protein  100 
 
 
189 aa  373  1e-102  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0808984  normal  0.841942 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0135  hypothetical protein  61.75 
 
 
182 aa  197  5e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0077  hypothetical protein  63.06 
 
 
198 aa  192  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5617  hypothetical protein  62.65 
 
 
169 aa  192  3e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.47308  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0833  hypothetical protein  60.77 
 
 
215 aa  191  4e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.568617 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4099  Protein of unknown function DUF2587  73.13 
 
 
169 aa  191  5e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0288  hypothetical protein  64.38 
 
 
184 aa  190  8e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0279  Protein of unknown function DUF2587  63.8 
 
 
182 aa  190  1e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0633676  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2102  hypothetical protein  57.99 
 
 
176 aa  188  4e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.590886 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5273  Protein of unknown function DUF2587  64.83 
 
 
181 aa  188  5e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.281014  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13814  hypothetical protein  62.8 
 
 
178 aa  188  5e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.482077 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3178  Protein of unknown function DUF2587  72.9 
 
 
199 aa  187  8e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.047355 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5371  hypothetical protein  71.32 
 
 
172 aa  187  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5078  hypothetical protein  71.32 
 
 
172 aa  187  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.959015 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4990  hypothetical protein  71.32 
 
 
172 aa  187  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0127  hypothetical protein  57.06 
 
 
187 aa  185  4e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1187  hypothetical protein  61.88 
 
 
173 aa  185  4e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.396204  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0071  hypothetical protein  59.12 
 
 
186 aa  183  1.0000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.254747  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0145  hypothetical protein  60.25 
 
 
169 aa  183  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.266352  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0179  hypothetical protein  53.09 
 
 
192 aa  181  5.0000000000000004e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.412757  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0683  hypothetical protein  59.54 
 
 
207 aa  181  5.0000000000000004e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.457589  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01600  Protein of unknown function (DUF2587)  61.82 
 
 
183 aa  180  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.620964  normal  0.0409014 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5036  hypothetical protein  58.79 
 
 
205 aa  180  1e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0482464 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0075  hypothetical protein  60.26 
 
 
179 aa  178  4.999999999999999e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.617604  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4526  hypothetical protein  54.5 
 
 
205 aa  177  5.999999999999999e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.99956 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0288  Protein of unknown function DUF2587  72.36 
 
 
184 aa  177  7e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0259  hypothetical protein  67.83 
 
 
204 aa  174  5e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105834 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0287  hypothetical protein  65.93 
 
 
210 aa  172  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4321  hypothetical protein  69.35 
 
 
190 aa  171  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01780  Protein of unknown function (DUF2587)  62.58 
 
 
165 aa  170  1e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.811908  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0109  hypothetical protein  56.35 
 
 
205 aa  168  6e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.479318  normal  0.676341 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0169  hypothetical protein  80.34 
 
 
209 aa  162  2.0000000000000002e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.804249  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1197  hypothetical protein  52.45 
 
 
158 aa  137  7.999999999999999e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.127086  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>