33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_01780 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_01780  Protein of unknown function (DUF2587)  100 
 
 		 165 aa  325  1.0000000000000001e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.811908  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0384  hypothetical protein  62.58 
 
 		 189 aa  192  2e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0808984  normal  0.841942 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2102  hypothetical protein  69.29 
 
 		 176 aa  182  3e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.590886 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0077  hypothetical protein  65.47 
 
 		 198 aa  176  9e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0179  hypothetical protein  58.23 
 
 		 192 aa  176  1e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.412757  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0288  hypothetical protein  62.84 
 
 		 184 aa  175  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0127  hypothetical protein  60.14 
 
 		 187 aa  174  3e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0071  hypothetical protein  63.57 
 
 		 186 aa  174  4e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.254747  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5371  hypothetical protein  58.6 
 
 		 172 aa  174  4e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5078  hypothetical protein  58.6 
 
 		 172 aa  174  4e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.959015 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4990  hypothetical protein  58.6 
 
 		 172 aa  174  4e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4099  Protein of unknown function DUF2587  56.97 
 
 		 169 aa  173  9.999999999999999e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1187  hypothetical protein  57.32 
 
 		 173 aa  171  5.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.396204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13814  hypothetical protein  65.15 
 
 		 178 aa  170  6.999999999999999e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.482077 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0279  Protein of unknown function DUF2587  54.49 
 
 		 182 aa  170  6.999999999999999e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0633676  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5617  hypothetical protein  61.54 
 
 		 169 aa  170  7.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.47308  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0145  hypothetical protein  62.79 
 
 		 169 aa  169  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.266352  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5273  Protein of unknown function DUF2587  52.41 
 
 		 181 aa  169  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.281014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0135  hypothetical protein  63.91 
 
 		 182 aa  169  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0075  hypothetical protein  62.5 
 
 		 179 aa  164  2.9999999999999998e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.617604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0833  hypothetical protein  54.49 
 
 		 215 aa  163  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.568617 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0169  hypothetical protein  67.76 
 
 		 209 aa  160  1e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.804249  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01600  Protein of unknown function (DUF2587)  59.54 
 
 		 183 aa  159  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.620964  normal  0.0409014 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5036  hypothetical protein  55.26 
 
 		 205 aa  159  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0482464 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0287  hypothetical protein  64.17 
 
 		 210 aa  159  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3178  Protein of unknown function DUF2587  61.31 
 
 		 199 aa  158  3e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.047355 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4526  hypothetical protein  54.61 
 
 		 205 aa  157  7e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.99956 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4321  hypothetical protein  64.17 
 
 		 190 aa  157  7e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0683  hypothetical protein  55.42 
 
 		 207 aa  157  8e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.457589  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0288  Protein of unknown function DUF2587  62.3 
 
 		 184 aa  154  5.0000000000000005e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0109  hypothetical protein  65.6 
 
 		 205 aa  149  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.479318  normal  0.676341 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0259  hypothetical protein  72.92 
 
 		 204 aa  148  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105834 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1197  hypothetical protein  54.62 
 
 		 158 aa  134  5e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.127086  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>