24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2916 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2916  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0850846  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3161t  tRNA-Val  95.52 
 
 		 73 bp  101  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0018  tRNA-Ala  91.07 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.916069 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0033  tRNA-Val  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0100  tRNA-OTHER  94.87 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.491699  normal  0.0284226 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0092  tRNA-Val  85.71 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.368967  normal  0.0448761 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0052  tRNA-Val  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00919857  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Val-1  tRNA-Val  86.79 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.133132  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0021  tRNA-Ala  86.79 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.656534 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0003  tRNA-Ala  88.46 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0157571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0054  tRNA-Ala  88.46 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.612853 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0052  tRNA-Ala  88.46 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.786637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0006  tRNA-Asp  85.45 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0002  tRNA-Asp  85.45 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna123  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.193593  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0045  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.760301  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0024  tRNA-Val  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0265895  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0059  tRNA-His  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0064  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.192566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0040  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0059  tRNA-His  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02187  tRNA-Val  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02186  tRNA-Val  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0088  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.109488  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>