13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2529 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2529  hypothetical protein  100 
 
 		 134 aa  277  3e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.945819  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1696  hypothetical protein  39.23 
 
 		 141 aa  110  9e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.661261  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1317  protein of unknown function DUF1486  27.13 
 
 		 138 aa  50.4  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.26628  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0376  Limonene-12-epoxide hydrolase  28.24 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.378531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3364  protein of unknown function DUF1486  28.57 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3231  ketosteroid isomerase-like protein  23.14 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.274911 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4363  ketosteroid isomerase-related protein-like protein  23.44 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.078923 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3755  ketosteroid isomerase-like protein  22.66 
 
 		 137 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5869  protein of unknown function DUF1486  24.62 
 
 		 138 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3764  hypothetical protein  26.4 
 
 		 359 aa  41.6  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0186816  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5856  protein of unknown function DUF1486  27.69 
 
 		 137 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10142  hypothetical protein  26.61 
 
 		 136 aa  40.4  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4426  hypothetical protein  28.68 
 
 		 141 aa  40.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0430646  normal  0.316047 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>