43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1953 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1953  hypothetical protein  100 
 
 		 245 aa  476  1e-133  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1220  hypothetical protein  73.75 
 
 		 244 aa  351  5e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.210254 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0164  membrane protein  75.95 
 
 		 244 aa  320  9.999999999999999e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.634614  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2271  hypothetical protein  68.51 
 
 		 245 aa  311  7.999999999999999e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00372269  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1826  hypothetical protein  69.04 
 
 		 244 aa  303  1.0000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.299788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1497  hypothetical protein  68.67 
 
 		 244 aa  301  6.000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.767246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1591  hypothetical protein  68.64 
 
 		 244 aa  300  1e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2762  hypothetical protein  68.22 
 
 		 244 aa  298  5e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0875471  normal  0.055304 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3684  hypothetical protein  67.21 
 
 		 248 aa  296  2e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3466  hypothetical protein  48.52 
 
 		 495 aa  233  3e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0165  membrane protein  49.81 
 
 		 261 aa  225  6e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1592  hypothetical protein  49.6 
 
 		 261 aa  216  2e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1088  protein of unknown function DUF1538  47.68 
 
 		 506 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2272  hypothetical protein  48.21 
 
 		 255 aa  210  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000140028  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1827  hypothetical protein  47.76 
 
 		 261 aa  208  5e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.149521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0802  protein of unknown function DUF1538  48.03 
 
 		 503 aa  208  6e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2761  hypothetical protein  47.56 
 
 		 263 aa  206  4e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.240414  normal  0.0518932 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1952  hypothetical protein  48.21 
 
 		 278 aa  205  6e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3479  hypothetical protein  42.98 
 
 		 245 aa  199  3e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405509 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1498  hypothetical protein  46.61 
 
 		 262 aa  198  7.999999999999999e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.660987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0659  hypothetical protein  44.63 
 
 		 503 aa  197  1.0000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201808 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3685  hypothetical protein  46.18 
 
 		 269 aa  193  2e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1221  ABC transporter for copper permease protein  48.41 
 
 		 264 aa  190  2e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.121957 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0800  protein of unknown function DUF1538  43.57 
 
 		 497 aa  182  3e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3478  hypothetical protein  38.27 
 
 		 255 aa  145  7.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.611874 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0745  hypothetical protein  36.56 
 
 		 231 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.189103  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0342  protein of unknown function DUF1538  36.56 
 
 		 253 aa  137  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510639 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0341  protein of unknown function DUF1538  33.33 
 
 		 230 aa  135  7.000000000000001e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766414 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0474  hypothetical protein  32.77 
 
 		 245 aa  132  6e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3139  membrane spanning protein  34.5 
 
 		 242 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0746  hypothetical protein  31.62 
 
 		 243 aa  125  8.000000000000001e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0127316  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0101  hypothetical protein  36.13 
 
 		 601 aa  117  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0337  hypothetical protein  35.5 
 
 		 232 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0876004  normal  0.856261 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0017  hypothetical protein  31.58 
 
 		 620 aa  112  5e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000261883  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0475  hypothetical protein  35.35 
 
 		 230 aa  111  8.000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0338  hypothetical protein  33.49 
 
 		 246 aa  109  5e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322383  normal  0.567105 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0908  protein of unknown function DUF1538  31.31 
 
 		 507 aa  102  5e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2615  hypothetical protein  29.37 
 
 		 508 aa  100  3e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0107308  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2378  hypothetical protein  34.44 
 
 		 646 aa  96.7  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1723  protein of unknown function DUF1538  30.87 
 
 		 288 aa  89.7  4e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1143  protein of unknown function DUF1538  29.83 
 
 		 497 aa  89  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150487  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0323  hypothetical protein  27.91 
 
 		 481 aa  87  2e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0750362  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1786  protein of unknown function DUF1538  28.04 
 
 		 545 aa  82  0.000000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0836999  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>