14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0569 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0569  hypothetical protein  100 
 
 		 694 aa  1439    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1434  hypothetical protein  28.79 
 
 		 689 aa  275  2.0000000000000002e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1666  hypothetical protein  30.51 
 
 		 699 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001762  hypothetical protein  29.95 
 
 		 620 aa  251  4e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1104  hypothetical protein  28.02 
 
 		 794 aa  201  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2795  hypothetical protein  27.08 
 
 		 792 aa  172  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1228  hypothetical protein  26.46 
 
 		 672 aa  168  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.566798 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0513  hypothetical protein  25.13 
 
 		 758 aa  167  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4416  putative lipoprotein  27.16 
 
 		 698 aa  44.3  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00872007 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4567  putative lipoprotein  27.16 
 
 		 698 aa  44.3  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0407808 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4567  hypothetical protein  27.16 
 
 		 698 aa  44.3  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4482  putative lipoprotein  27.16 
 
 		 698 aa  44.3  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4619  putative lipoprotein  27.16 
 
 		 698 aa  43.9  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.264155 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3793  protein of unknown function DUF940 membrane lipoprotein putative  30.46 
 
 		 1261 aa  44.3  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>