More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1130 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0620  NAD+ synthetase  51.4 
 
 
644 aa  649    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.232331  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3426  NAD+ synthetase  55.02 
 
 
647 aa  681    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0325  NAD synthetase  56.47 
 
 
645 aa  752    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0404544  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2216  NAD synthetase  51.83 
 
 
652 aa  679    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808702  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0182  NAD+ synthetase  51.13 
 
 
676 aa  652    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1314  NAD synthetase  98.27 
 
 
635 aa  1291    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103341  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1130  NAD synthetase  100 
 
 
635 aa  1306    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1200  NAD synthetase  54.21 
 
 
642 aa  709    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0531  NAD synthetase  48.41 
 
 
647 aa  631  1e-179  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2164  NAD synthetase  42.11 
 
 
689 aa  551  1e-155  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2610  NAD synthetase  43.38 
 
 
682 aa  548  1e-154  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2679  NAD synthetase  44.7 
 
 
686 aa  546  1e-154  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2204  NAD synthetase  43.84 
 
 
692 aa  544  1e-153  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0453723  normal  0.881972 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2169  NAD synthetase  42.49 
 
 
685 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0634324  hitchhiker  0.00000227772 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3909  NAD synthase  44.02 
 
 
678 aa  540  9.999999999999999e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0680  NAD synthetase  43.35 
 
 
716 aa  541  9.999999999999999e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.576503 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2095  NAD synthetase  41.5 
 
 
714 aa  537  1e-151  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3633  NAD+ synthetase  41.83 
 
 
704 aa  533  1e-150  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400497  hitchhiker  0.00213692 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2533  NAD synthetase  41.64 
 
 
691 aa  523  1e-147  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4405  NAD synthetase  42.51 
 
 
690 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.863566  normal  0.125329 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2595  NAD synthetase  41.93 
 
 
687 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.649167  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4035  NAD synthetase  42.36 
 
 
690 aa  513  1e-144  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0650104 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0919  NAD synthetase  41.03 
 
 
802 aa  513  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4914  NAD synthetase  42.45 
 
 
683 aa  511  1e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0979  NAD synthetase  42.72 
 
 
678 aa  507  9.999999999999999e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.989674  normal  0.179553 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1782  NAD+ synthetase  41.61 
 
 
686 aa  504  1e-141  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0217619 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4517  NAD synthetase  41.75 
 
 
690 aa  505  1e-141  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.516148 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1103  NAD synthetase  40.7 
 
 
684 aa  498  1e-140  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.635077 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0483  NAD+ synthetase  40.45 
 
 
679 aa  493  9.999999999999999e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3750  NAD synthetase  41.44 
 
 
699 aa  489  1e-137  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0534527 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5214  NAD+ synthetase  39.37 
 
 
680 aa  490  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0536681  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2044  NAD synthetase  39.06 
 
 
681 aa  488  1e-136  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4206  NAD synthetase  41.95 
 
 
681 aa  485  1e-135  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2890  NAD synthetase  41.01 
 
 
679 aa  477  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3940  NAD synthetase  38.86 
 
 
680 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381812  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3548  NAD synthetase  39.27 
 
 
680 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3543  NAD synthetase  39.27 
 
 
680 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3616  NAD synthetase  39.27 
 
 
680 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.4812  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3271  NAD(+) synthase (glutamine-hydrolyzing)  39.27 
 
 
682 aa  463  1e-129  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4906  NAD synthetase  41.62 
 
 
679 aa  463  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0664942  hitchhiker  0.00795147 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2642  NAD synthetase  38.55 
 
 
680 aa  462  9.999999999999999e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.309043  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12465  NAD synthetase  38.52 
 
 
738 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000230879  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1400  NAD synthetase  41.28 
 
 
650 aa  409  1e-113  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0507  NAD+ synthetase  36.81 
 
 
600 aa  386  1e-106  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28360  NAD synthase  45.07 
 
 
846 aa  307  5.0000000000000004e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.455485  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0767  NAD+ synthetase  27.62 
 
 
583 aa  201  3.9999999999999996e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.296939  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3480  NAD+ synthetase  26.54 
 
 
587 aa  197  6e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0342868  normal  0.0247199 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1558  NAD+ synthetase  27.85 
 
 
573 aa  192  1e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0286387  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0553  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  26.63 
 
 
577 aa  183  1e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.795829  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0640  NAD+ synthetase  27.18 
 
 
700 aa  182  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0635505 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1409  NAD synthetase  27.07 
 
 
561 aa  182  2e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1869  NAD+ synthetase  27.11 
 
 
575 aa  181  2.9999999999999997e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0461361  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1518  NAD synthetase  28.14 
 
 
576 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0296  NAD+ synthetase  26.3 
 
 
567 aa  180  8e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.50614  normal  0.755509 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0270  putative NH3-dependent (glutamine-hydrolyzing) NAD(+) synthetase  26.3 
 
 
567 aa  180  9e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1567  NAD synthetase  28.06 
 
 
576 aa  179  1e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1882  NAD+ synthetase  27.24 
 
 
552 aa  177  5e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6745  NAD+ synthetase  24.53 
 
 
688 aa  176  9e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.960806 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1404  NAD synthetase  28.17 
 
 
574 aa  172  1e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0189594  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0922  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  26.92 
 
 
542 aa  172  1e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.906814  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2763  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  26.34 
 
 
577 aa  172  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1045  NAD+ synthetase  25.79 
 
 
658 aa  169  1e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.700176  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1093  NAD+ synthetase  26.75 
 
 
542 aa  169  1e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.588996  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2417  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  26.46 
 
 
626 aa  165  3e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.906393  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2296  NAD+ synthetase  24.37 
 
 
543 aa  164  6e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_940  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  25.97 
 
 
566 aa  161  4e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0417  NAD synthetase  25.34 
 
 
566 aa  160  9e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.974378  normal  0.0364261 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2535  NAD+ synthetase  24.33 
 
 
538 aa  156  1e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0951  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  26.16 
 
 
566 aa  156  1e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1122  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  25.27 
 
 
566 aa  155  2e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.049761  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3032  NAD synthetase  26.17 
 
 
561 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3089  NAD synthetase  26.17 
 
 
561 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.447484  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0150  NAD+ synthetase  24.76 
 
 
543 aa  155  2e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2832  NAD+ synthetase  25.19 
 
 
686 aa  155  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1290  NAD synthetase  25.19 
 
 
538 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.279167 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0290  NAD synthetase  25.08 
 
 
560 aa  154  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.950907 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1036  NAD+ synthetase  24.49 
 
 
558 aa  154  7e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0811  NAD+ synthetase  23.49 
 
 
546 aa  153  8e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0311  NAD+ synthetase  24.3 
 
 
567 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2360  NAD+ synthetase  23.52 
 
 
564 aa  152  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.869499  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1737  NAD+ synthetase  25.48 
 
 
552 aa  151  3e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.364272 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2309  NAD+ synthetase  26.74 
 
 
562 aa  150  5e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1761  NAD+ synthetase  23.21 
 
 
554 aa  150  7e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15260  NAD+ synthetase  23.46 
 
 
553 aa  150  7e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.874771  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0411  NAD+ synthetase  24.57 
 
 
546 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.172115 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1984  NAD synthetase  25.19 
 
 
584 aa  150  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.187378  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0876  NAD+ synthetase  26.15 
 
 
554 aa  149  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1524  NAD+ synthetase  25.35 
 
 
559 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.14105 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3217  NAD+ synthetase  24.88 
 
 
557 aa  148  3e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0268  NAD synthetase  26.05 
 
 
561 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1990  NAD+ synthetase  23.32 
 
 
561 aa  147  5e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0918  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  23.47 
 
 
591 aa  147  5e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.262249  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3162  NAD synthetase  24.76 
 
 
544 aa  147  5e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11920  glutamine-dependent NAD+ synthase  24.84 
 
 
556 aa  147  6e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1961  NAD+ synthetase  23.09 
 
 
554 aa  147  7.0000000000000006e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0268  NAD synthetase  26.05 
 
 
561 aa  147  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0572  NAD+ synthetase  24.02 
 
 
552 aa  147  9e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.323116  normal  0.812865 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2553  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  25.73 
 
 
540 aa  145  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0396005 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0969  NAD(+) synthetase  24.91 
 
 
539 aa  145  3e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0887  NAD synthetase  24.23 
 
 
545 aa  145  3e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>