19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0414 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_0414  hypothetical protein  100 
 
 
525 aa  1016    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.512337  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0418  hypothetical protein  66.79 
 
 
533 aa  675    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5035  hypothetical protein  22.88 
 
 
459 aa  94.7  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5590  hypothetical protein  23.39 
 
 
459 aa  88.6  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00129061 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0715  hypothetical protein  24.66 
 
 
516 aa  86.7  9e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5483  hypothetical protein  21.57 
 
 
459 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5092  hypothetical protein  21.57 
 
 
459 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5362  hypothetical protein  21.56 
 
 
466 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4922  hypothetical protein  21.37 
 
 
459 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5414  hypothetical protein  21.77 
 
 
459 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5332  hypothetical protein  21.57 
 
 
459 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000201181 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4937  hypothetical protein  21.37 
 
 
459 aa  80.5  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0115  hypothetical protein  25.63 
 
 
416 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5366  hypothetical protein  20.08 
 
 
459 aa  77.8  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0113  hypothetical protein  25.19 
 
 
416 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000218142  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1305  IG hypothetical 16680  22.09 
 
 
411 aa  61.6  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4039  IG hypothetical 16680  21.62 
 
 
411 aa  60.1  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1156  hypothetical protein  20.93 
 
 
410 aa  58.2  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1653  hypothetical protein  26.3 
 
 
424 aa  43.5  0.009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00215239  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>