30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2760 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2760  hypothetical protein  100 
 
 		 109 aa  214  5e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2445  hypothetical protein  98.17 
 
 		 109 aa  210  4.9999999999999996e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.758791  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0157  protein of unknown function DUF970  54.13 
 
 		 109 aa  124  3e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0513  protein of unknown function DUF970  51.38 
 
 		 109 aa  122  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0034  protein of unknown function DUF970  55.05 
 
 		 111 aa  122  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0054  hypothetical protein  51.38 
 
 		 109 aa  122  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.266654  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2941  protein of unknown function DUF970  50.5 
 
 		 108 aa  115  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.203719 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1127  protein of unknown function DUF970  53.21 
 
 		 109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000158497  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0504  hypothetical protein  50 
 
 		 109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0517  hypothetical protein  50 
 
 		 109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0474282  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0121  hypothetical protein  49.06 
 
 		 109 aa  112  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2374  protein of unknown function DUF970  44.95 
 
 		 109 aa  108  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0122  protein of unknown function DUF970  49.06 
 
 		 109 aa  106  8.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0604133  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3231  hypothetical protein  48.51 
 
 		 112 aa  106  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3719  hypothetical protein  47.52 
 
 		 115 aa  105  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00413752 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1670  hypothetical protein  44.95 
 
 		 109 aa  102  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.108854 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0682  protein of unknown function DUF970  46.36 
 
 		 109 aa  100  7e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0280  hypothetical protein  44.34 
 
 		 109 aa  95.9  2e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1349  hypothetical protein  48.21 
 
 		 112 aa  94.4  5e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.6522  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0331  hypothetical protein  42.2 
 
 		 107 aa  94  6e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0373  hypothetical protein  44.34 
 
 		 111 aa  90.5  7e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000275658 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20370  hypothetical protein  46.25 
 
 		 80 aa  87.8  5e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1406  hypothetical protein  41.44 
 
 		 108 aa  81.3  0.000000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.38193  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1048  protein of unknown function DUF970  38.68 
 
 		 122 aa  76.3  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0788  protein of unknown function DUF970  35.45 
 
 		 108 aa  74.3  0.0000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2607  protein of unknown function DUF970  36.94 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000153353  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2960  protein of unknown function DUF970  52.46 
 
 		 80 aa  64.7  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000522235 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3470  hypothetical protein  49.18 
 
 		 80 aa  61.6  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136027  hitchhiker  0.00982408 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1490  hypothetical protein  49.18 
 
 		 80 aa  60.8  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.302129  normal  0.540685 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0569  isochorismatase family protein  32.53 
 
 		 206 aa  40.4  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>