27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1490 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_1490  hypothetical protein  100 
 
 
80 aa  152  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.302129  normal  0.540685 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3470  hypothetical protein  95 
 
 
80 aa  145  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136027  hitchhiker  0.00982408 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2960  protein of unknown function DUF970  75 
 
 
80 aa  122  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000522235 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2374  protein of unknown function DUF970  53.12 
 
 
109 aa  70.9  0.000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1127  protein of unknown function DUF970  48.44 
 
 
109 aa  70.1  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000158497  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0122  protein of unknown function DUF970  46.88 
 
 
109 aa  64.3  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0604133  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2941  protein of unknown function DUF970  47.54 
 
 
108 aa  63.5  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.203719 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0034  protein of unknown function DUF970  46.88 
 
 
111 aa  61.2  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0504  hypothetical protein  43.75 
 
 
109 aa  60.1  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0054  hypothetical protein  43.75 
 
 
109 aa  59.3  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.266654  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0517  hypothetical protein  43.75 
 
 
109 aa  60.1  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0474282  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0121  hypothetical protein  46.67 
 
 
109 aa  58.5  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0373  hypothetical protein  37.5 
 
 
111 aa  58.2  0.00000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000275658 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3719  hypothetical protein  49.18 
 
 
115 aa  57  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00413752 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3231  hypothetical protein  49.18 
 
 
112 aa  57  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1406  hypothetical protein  40.62 
 
 
108 aa  56.6  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.38193  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1670  hypothetical protein  56 
 
 
109 aa  55.5  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.108854 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1349  hypothetical protein  35.94 
 
 
112 aa  55.5  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.6522  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0513  protein of unknown function DUF970  37.5 
 
 
109 aa  53.5  0.0000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0157  protein of unknown function DUF970  35.94 
 
 
109 aa  53.1  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2445  hypothetical protein  49.18 
 
 
109 aa  52  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.758791  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2760  hypothetical protein  49.18 
 
 
109 aa  52  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0280  hypothetical protein  34.38 
 
 
109 aa  50.8  0.000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0331  hypothetical protein  31.25 
 
 
107 aa  47.8  0.00004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0682  protein of unknown function DUF970  37.5 
 
 
109 aa  48.1  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2607  protein of unknown function DUF970  33.87 
 
 
108 aa  45.8  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000153353  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20370  hypothetical protein  50 
 
 
80 aa  41.6  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>