26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3470 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3470  hypothetical protein  100 
 
 		 80 aa  155  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136027  hitchhiker  0.00982408 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1490  hypothetical protein  95 
 
 		 80 aa  145  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.302129  normal  0.540685 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2960  protein of unknown function DUF970  71.25 
 
 		 80 aa  114  5e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000522235 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1127  protein of unknown function DUF970  50.82 
 
 		 109 aa  69.3  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000158497  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2374  protein of unknown function DUF970  54.1 
 
 		 109 aa  68.6  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2941  protein of unknown function DUF970  49.18 
 
 		 108 aa  65.1  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.203719 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0504  hypothetical protein  45.31 
 
 		 109 aa  60.8  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0121  hypothetical protein  45.31 
 
 		 109 aa  60.8  0.000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0517  hypothetical protein  45.31 
 
 		 109 aa  60.8  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0474282  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0034  protein of unknown function DUF970  46.77 
 
 		 111 aa  59.3  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0054  hypothetical protein  46.67 
 
 		 109 aa  59.3  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.266654  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0122  protein of unknown function DUF970  45.9 
 
 		 109 aa  58.2  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0604133  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3719  hypothetical protein  49.18 
 
 		 115 aa  57.4  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00413752 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3231  hypothetical protein  49.18 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0373  hypothetical protein  37.5 
 
 		 111 aa  55.8  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000275658 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1406  hypothetical protein  42.62 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.38193  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1670  hypothetical protein  56 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.108854 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1349  hypothetical protein  37.7 
 
 		 112 aa  53.5  0.0000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.6522  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2445  hypothetical protein  49.18 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.758791  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2760  hypothetical protein  49.18 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0513  protein of unknown function DUF970  38.33 
 
 		 109 aa  51.2  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0157  protein of unknown function DUF970  37.7 
 
 		 109 aa  50.8  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0280  hypothetical protein  36.07 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0331  hypothetical protein  34.38 
 
 		 107 aa  47  0.00008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0682  protein of unknown function DUF970  37.5 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2607  protein of unknown function DUF970  34.43 
 
 		 108 aa  43.9  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000153353  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>