29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1670 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1670  hypothetical protein  100 
 
 
109 aa  217  5e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.108854 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2374  protein of unknown function DUF970  59.63 
 
 
109 aa  137  3.9999999999999997e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0682  protein of unknown function DUF970  50.46 
 
 
109 aa  110  6e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0054  hypothetical protein  47.71 
 
 
109 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.266654  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0517  hypothetical protein  48.11 
 
 
109 aa  107  8.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0474282  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0504  hypothetical protein  48.11 
 
 
109 aa  107  8.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2941  protein of unknown function DUF970  48.08 
 
 
108 aa  104  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.203719 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0121  hypothetical protein  46.23 
 
 
109 aa  104  4e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0122  protein of unknown function DUF970  46.23 
 
 
109 aa  99.8  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0604133  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0373  hypothetical protein  45.28 
 
 
111 aa  97.4  5e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000275658 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3719  hypothetical protein  47.52 
 
 
115 aa  96.3  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00413752 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0034  protein of unknown function DUF970  43.12 
 
 
111 aa  95.5  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3231  hypothetical protein  46.53 
 
 
112 aa  95.1  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0513  protein of unknown function DUF970  41.28 
 
 
109 aa  94  6e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1127  protein of unknown function DUF970  39.45 
 
 
109 aa  94  7e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000158497  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0331  hypothetical protein  39.81 
 
 
107 aa  90.5  7e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0280  hypothetical protein  36.79 
 
 
109 aa  89.4  2e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0157  protein of unknown function DUF970  41.82 
 
 
109 aa  86.7  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2445  hypothetical protein  44.95 
 
 
109 aa  81.6  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.758791  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2760  hypothetical protein  44.95 
 
 
109 aa  81.3  0.000000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1406  hypothetical protein  36.79 
 
 
108 aa  80.9  0.000000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.38193  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20370  hypothetical protein  42.5 
 
 
80 aa  80.5  0.000000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0788  protein of unknown function DUF970  37.61 
 
 
108 aa  79.7  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2607  protein of unknown function DUF970  36.7 
 
 
108 aa  70.9  0.000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000153353  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1349  hypothetical protein  34.82 
 
 
112 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.6522  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2960  protein of unknown function DUF970  43.75 
 
 
80 aa  57  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000522235 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1490  hypothetical protein  56 
 
 
80 aa  55.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.302129  normal  0.540685 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3470  hypothetical protein  56 
 
 
80 aa  55.5  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.136027  hitchhiker  0.00982408 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1048  protein of unknown function DUF970  26.21 
 
 
122 aa  49.3  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>