15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2234 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2234  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 272 aa  536  1e-151  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1946  TPR repeat-containing protein  96.69 
 
 		 272 aa  520  1e-146  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0650  TPR domain-containing protein  29.12 
 
 		 266 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.333953  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0639  TPR repeat-containing protein  29.12 
 
 		 267 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.554233  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1030  TPR repeat-containing protein  28.85 
 
 		 274 aa  90.5  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.023544  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3209  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.73 
 
 		 234 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00149401  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  29.07 
 
 		 3172 aa  45.4  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  29.07 
 
 		 3301 aa  45.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  26.8 
 
 		 833 aa  45.4  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  22.63 
 
 		 1013 aa  44.3  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  24.42 
 
 		 1421 aa  43.5  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  23.36 
 
 		 1737 aa  42.7  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0430  TPR domain-containing protein  25 
 
 		 338 aa  42.7  0.007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0605051  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.15 
 
 		 352 aa  42.4  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.913573  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1345  TPR repeat-containing protein  23.77 
 
 		 332 aa  42.4  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>