17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1717 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1717  PTS system, IIA component  100 
 
 		 139 aa  271  3e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1951  PTS system, IIA component, putative  51.43 
 
 		 141 aa  137  3.9999999999999997e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3474  PTS system fructose subfamily IIA component  34.96 
 
 		 145 aa  74.3  0.0000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.155364  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0517  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  30.07 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000842573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4943  PTS system fructose subfamily IIA component  29.27 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4949  PTS system fructose subfamily transporter subunit IIA  29.27 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.273021  normal  0.330081 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4890  PTS system fructose subfamily transporter subunit IIA  29.27 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.819144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4789  PTS system fructose subfamily IIA component  29.27 
 
 		 140 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.659132 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3953  PTS system fructose subfamily IIA component  34.68 
 
 		 160 aa  62  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.808645  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0689  putative PTS system mannose-specific enzyme iiab  29.17 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.190711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0630  putative PTS system mannose-specific transporter subunit IIAB  29.17 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0948  PTS system fructose subfamily IIA component  29.1 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0404  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIA subunit  26.45 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686835  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0400  PTS system fructose IIA subunit  25.62 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1317  PTS system fructose subfamily IIA component  26.39 
 
 		 143 aa  45.1  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.358134  normal  0.253004 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0150  PTS system fructose subfamily IIA component  28.37 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3255  PTS system fructose subfamily IIA component  28.95 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.622131  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>