34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0404 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0404  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIA subunit  100 
 
 		 137 aa  271  1.0000000000000001e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686835  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0400  PTS system fructose IIA subunit  98.53 
 
 		 137 aa  267  4e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0150  PTS system fructose subfamily IIA component  36.63 
 
 		 141 aa  67  0.00000000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1902  PTS system, IIA component  24.41 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00331996  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3396  PTS system fructose subfamily IIA component  29.7 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0818  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIB subunit  27.03 
 
 		 326 aa  52.8  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0804  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIAB subunit  28.57 
 
 		 326 aa  52.8  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0345  PTS system, IIA component  25.74 
 
 		 143 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0200  protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  24.11 
 
 		 329 aa  49.7  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000259121  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0120  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  27.36 
 
 		 132 aa  50.1  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000167564  hitchhiker  1.7476000000000002e-20 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0464  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  28.57 
 
 		 332 aa  48.9  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000027828  normal  0.826743 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3696  PTS system fructose subfamily IIA component  31.88 
 
 		 143 aa  48.9  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000385193  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1717  PTS system, IIA component  26.45 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3576  PTS system fructose subfamily IIA component  26.67 
 
 		 144 aa  47  0.00009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.440401  normal  0.531464 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2390  PTS system fructose subfamily IIA component  23.81 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0132  PTS system fructose subfamily IIA component  27.45 
 
 		 136 aa  45.1  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0464  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  25 
 
 		 331 aa  44.3  0.0005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000451703  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03001  putative phosphotransferase system enzyme subunit (N-acetyl-galactosamine/galactosamine PTS system enzyme IIA component)  26.19 
 
 		 144 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3326  PTS system, mannose/sorbose-specific, IIA component  26.19 
 
 		 144 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3616  PTS system, mannose/sorbose-specific, IIA component  26.19 
 
 		 144 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0564  PTS system fructose subfamily IIA component  26.19 
 
 		 144 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.576662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02952  hypothetical protein  26.19 
 
 		 144 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1665  PTS system fructose subfamily IIA component  30.43 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000418969  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1068  PTS system fructose subfamily IIA component  23 
 
 		 146 aa  42.7  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1273  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  23.39 
 
 		 143 aa  42.7  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0243136  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0382  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  28.57 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3022  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIA subunit  31.68 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3433  PTS system, mannose/sorbose-specific, IIA component  26.19 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1204  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  31.43 
 
 		 100 aa  41.2  0.004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4450  PTS system, mannose/sorbose-specific, IIA component  25.4 
 
 		 144 aa  41.2  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.236223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1795  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  22.94 
 
 		 332 aa  40.8  0.007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.172068  hitchhiker  1.3720900000000001e-24 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0948  PTS system fructose subfamily IIA component  27.82 
 
 		 137 aa  40.4  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3009  PTS system fructose subfamily IIA component  24.81 
 
 		 142 aa  40.4  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0677471  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3429  PTS system fructose subfamily IIA component  25.37 
 
 		 141 aa  40.4  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225733  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>