12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNJ00260 on replicon NC_006679
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006679  CNJ00260  cytoplasm protein, putative  100 
 
 		 357 aa  710    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10257  KH domain RNA binding protein (AFU_orthologue; AFUA_2G04940)  52.98 
 
 		 465 aa  178  2e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND03070  cytoplasm protein, putative  34.89 
 
 		 365 aa  170  3e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.205748  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_76889  PAB1 binding protein  43.81 
 
 		 500 aa  167  2e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0374206 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04546  KH domain RNA-binding protein (AFU_orthologue; AFUA_2G02780)  28.08 
 
 		 542 aa  146  4.0000000000000006e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00000459967  normal  0.0749815 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28758  predicted protein  30.56 
 
 		 340 aa  125  1e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.79308  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62156  predicted protein  29.58 
 
 		 343 aa  117  1.9999999999999998e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.474155  normal  0.0819638 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15661  predicted protein  25.88 
 
 		 651 aa  71.2  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.598377 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44729  predicted protein  26.98 
 
 		 699 aa  60.5  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.189195  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_40453  predicted protein  34.25 
 
 		 297 aa  55.5  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_89194  predicted protein  24.03 
 
 		 310 aa  46.6  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.915191  hitchhiker  0.00870525 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47861  predicted protein  25.63 
 
 		 1234 aa  45.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.090651  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>