13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CND03070 on replicon NC_006686
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006686  CND03070  cytoplasm protein, putative  100 
 
 		 365 aa  726    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.205748  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04546  KH domain RNA-binding protein (AFU_orthologue; AFUA_2G02780)  52.89 
 
 		 542 aa  328  1.0000000000000001e-88  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00000459967  normal  0.0749815 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10257  KH domain RNA binding protein (AFU_orthologue; AFUA_2G04940)  35.18 
 
 		 465 aa  170  4e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00260  cytoplasm protein, putative  41.24 
 
 		 357 aa  133  6e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62156  predicted protein  40.4 
 
 		 343 aa  131  2.0000000000000002e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.474155  normal  0.0819638 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_76889  PAB1 binding protein  31.11 
 
 		 500 aa  109  9.000000000000001e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0374206 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28758  predicted protein  31.14 
 
 		 340 aa  67.8  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.79308  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15661  predicted protein  24.83 
 
 		 651 aa  65.5  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.598377 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44729  predicted protein  31.03 
 
 		 699 aa  57.8  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.189195  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28250  predicted protein  25.86 
 
 		 437 aa  48.9  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.522861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_40453  predicted protein  30.43 
 
 		 297 aa  45.8  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_89194  predicted protein  29.38 
 
 		 310 aa  45.4  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.915191  hitchhiker  0.00870525 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47861  predicted protein  27.5 
 
 		 1234 aa  43.1  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.090651  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>