11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNB03140 on replicon NC_006684
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006684  CNB03140  ubiquitin-protein ligase, putative  100 
 
 		 142 aa  298  2e-80  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0134629  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08844  RING-box protein 1 (Broad)  76.83 
 
 		 116 aa  142  1e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.43925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_37145  Skp1 Cullin-F-box ubiquitin protein ligase (SCF) subunit  52.69 
 
 		 113 aa  114  3e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39090  predicted protein  46.59 
 
 		 134 aa  95.9  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119493  RING-box protein 1  50 
 
 		 110 aa  85.9  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0313077  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10394  anaphase promoting complex subunit Apc11, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G01380)  32.43 
 
 		 104 aa  52.8  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.136684  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04200  ubiquitin-protein ligase, putative  24.74 
 
 		 114 aa  48.1  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.267821  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_9831  predicted protein  35.53 
 
 		 85 aa  47  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.320101 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10271  predicted protein  30.43 
 
 		 82 aa  46.2  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.804871  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86664  ubiquitin-protein ligase Anaphase Promoting Complex  27.63 
 
 		 136 aa  42  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_3177  predicted protein  34.88 
 
 		 341 aa  42  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.80791 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>