21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_1062 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008787  CJJ81176_1062  hypothetical protein  100 
 
 
283 aa  552  1e-156  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.930441  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1185  hypothetical protein  98.94 
 
 
283 aa  548  1e-155  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.561185  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0124  conserved hypothetical protein, probable ATP/GTP-binding protein  58.51 
 
 
278 aa  311  9e-84  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.305705  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2273  hypothetical protein  28.41 
 
 
294 aa  87.8  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0066  putative ATP/GTP-binding protein  28.57 
 
 
304 aa  86.3  6e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.268496 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1927  ATP/GTP-binding  38.36 
 
 
275 aa  82.8  0.000000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0892  hypothetical protein  27.48 
 
 
288 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.237155 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1036  hypothetical protein  27.48 
 
 
288 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.582749  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2648  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.96 
 
 
330 aa  82  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0707367  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0453  periplasmic ATP/GTP-binding protein  31.27 
 
 
273 aa  80.9  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.879062  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1011  periplasmic ATP/GTP-binding protein  27.96 
 
 
296 aa  79.3  0.00000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134126  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2463  periplasmic ATP/GTP-binding protein  28.88 
 
 
311 aa  78.2  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000157252  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1289  putative periplasmic ATP/GTP-binding protein  51.56 
 
 
73 aa  73.6  0.000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0256808  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0374  periplasmic ATP/GTP-binding protein  31.25 
 
 
288 aa  72.8  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3578  ATP/GTP-binding  28.92 
 
 
308 aa  65.5  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.723443  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3843  NHL repeat containing protein  35 
 
 
282 aa  62  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2979  ATP/GTP-binding  31.82 
 
 
277 aa  60.8  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0296682  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0980  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  25.82 
 
 
445 aa  56.2  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0105637 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0535  NHL repeat-containing protein  26.19 
 
 
642 aa  55.8  0.0000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000386483  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0841  hypothetical protein  28.91 
 
 
244 aa  50.1  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2945  hypothetical protein  26.64 
 
 
288 aa  45.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>