33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_1060 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008787  CJJ81176_1060  putative transmembrane transport protein  100 
 
 		 109 aa  219  7e-57  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1184  hypothetical protein  80.58 
 
 		 387 aa  163  5.9999999999999996e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.497488  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1011  major facilitator superfamily transporter  45.1 
 
 		 390 aa  91.3  4e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.355003  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2380  major facilitator transporter  34.29 
 
 		 403 aa  48.1  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4620  major facilitator superfamily MFS_1  42.59 
 
 		 430 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.81527  normal  0.142468 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4352  major facilitator superfamily MFS_1  42.59 
 
 		 430 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.174626 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0340  major facilitator transporter  35 
 
 		 403 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0350  major facilitator transporter  35 
 
 		 403 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.586381 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0329  major facilitator transporter  35 
 
 		 403 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0017  major facilitator transporter  41.18 
 
 		 406 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.351593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0868  major facilitator superfamily MFS_1  33.87 
 
 		 397 aa  46.6  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5879  major facilitator superfamily MFS_1  37.5 
 
 		 445 aa  46.6  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1423  major facilitator superfamily MFS_1  32.2 
 
 		 428 aa  45.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3502  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 437 aa  45.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0069474 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1579  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 439 aa  45.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0385849  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3920  cynate permease protein  37.5 
 
 		 426 aa  44.7  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.791953  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0951  major facilitator superfamily transporter  36.54 
 
 		 406 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3781  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 444 aa  44.3  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1932  major facilitator transporter  26.44 
 
 		 366 aa  43.5  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.939532  normal  0.256076 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1563  major facilitator transporter  34.43 
 
 		 403 aa  43.5  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3144  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 411 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.586682  hitchhiker  0.00799883 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0902  major facilitator superfamily MFS_1  29.41 
 
 		 397 aa  42.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.167375  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0924  major facilitator superfamily MFS_1  28.36 
 
 		 424 aa  42.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.427807  normal  0.0559482 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0043  major facilitator superfamily MFS_1  30.88 
 
 		 410 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.973221  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1341  major facilitator superfamily MFS_1  34.43 
 
 		 426 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.141692  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4548  major facilitator superfamily MFS_1  32.84 
 
 		 404 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43490  putative cyanate MFS transporter  29.11 
 
 		 424 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3476  major facilitator superfamily MFS_1  32.84 
 
 		 404 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.126781 
 
 
-
 
NC_003296  RS01782  putative CYNX-related transport transmembrane protein  31.34 
 
 		 426 aa  40.8  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4528  major facilitator transporter  31.75 
 
 		 414 aa  41.2  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228115 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2702  major facilitator transporter  35.38 
 
 		 432 aa  40.8  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.11554  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2806  major facilitator superfamily MFS_1  31.15 
 
 		 403 aa  40.8  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.221389  normal  0.990048 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3647  MFS family transporter  27.85 
 
 		 424 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>