46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0236 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE0236  baseplate assembly protein V, putative  100 
 
 		 210 aa  424  1e-118  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.24138  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0869  phage baseplate assembly protein V  27.98 
 
 		 211 aa  77.4  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0625663 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4377  baseplate assembly protein V  29.5 
 
 		 213 aa  75.9  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000317032 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1827  phage baseplate assembly protein V  28.08 
 
 		 217 aa  74.3  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0087576  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2902  phage baseplate assembly protein V  25.15 
 
 		 202 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.684601 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4337  phage baseplate assembly protein GpV  26.92 
 
 		 211 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0120707 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3039  phage baseplate assembly protein GpV  26.24 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000239621 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3187  phage baseplate assembly protein V  26.13 
 
 		 213 aa  69.7  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.701564  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0642  prophage LambdaW5, baseplate assembly protein V  30.71 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.392908  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01346  phage-related baseplate protein  29.45 
 
 		 187 aa  69.3  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.261049  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0406  phage-related baseplate assembly protein  30.54 
 
 		 195 aa  68.2  0.00000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1145  phage-related baseplate assembly protein  30.54 
 
 		 195 aa  68.2  0.00000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2090  phage baseplate assembly protein V  27.59 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.041892  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3488  phage baseplate assembly protein V  26.57 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0856237 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1388  Phage-related baseplate assembly protein V  29.59 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.595566  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1165  phage baseplate assembly protein V  30.25 
 
 		 195 aa  64.3  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0364  phage baseplate assembly protein V  30.25 
 
 		 195 aa  64.3  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2652  phage baseplate assembly protein V  26.87 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0950236  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2341  phage baseplate assembly protein V  25.87 
 
 		 211 aa  62  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.962217  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1337  hypothetical protein  24.64 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.19388  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0893  phage baseplate assembly protein V  22.78 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.176645  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3051  pyocin R2_PP  25.76 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.271158 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1573  phage baseplate assembly protein V  26.55 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.551367  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3300  phage baseplate assembly protein V  23.32 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4849  phage baseplate assembly protein V  22.22 
 
 		 210 aa  52.8  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3403  baseplate assembly protein V  23.94 
 
 		 187 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08010  hypothetical protein  22.83 
 
 		 185 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000196385  hitchhiker  0.000218842 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2889  phage baseplate assembly protein V  25.99 
 
 		 193 aa  51.6  0.000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.200609  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3822  phage baseplate assembly protein V  26.55 
 
 		 193 aa  51.6  0.000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0687  Phage baseplate assembly protein V  29.45 
 
 		 221 aa  50.8  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37480  Phage P2 baseplate assembly gpV-like protein  27.18 
 
 		 180 aa  51.2  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0194  phage baseplate assembly protein V  21.43 
 
 		 234 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.263934 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2765  phage baseplate assembly protein V  23.9 
 
 		 192 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000252262 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00847  hypothetical protein  22.98 
 
 		 192 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1868  phage baseplate assembly protein V  23.08 
 
 		 226 aa  49.7  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3037  phage baseplate assembly protein V  23.27 
 
 		 192 aa  48.9  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000236294 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2854  phage baseplate assembly protein V  22.88 
 
 		 192 aa  48.5  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00841  hypothetical protein  22.98 
 
 		 273 aa  48.5  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0936  phage baseplate assembly protein V  22.64 
 
 		 192 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1217  phage baseplate assembly protein V  32.35 
 
 		 159 aa  47.4  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0760  hypothetical protein  21.28 
 
 		 185 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0803813  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4046  phage baseplate assembly protein V  21.72 
 
 		 186 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000659846  hitchhiker  0.000000000000714572 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2218  phage baseplate assembly protein V  26.73 
 
 		 301 aa  42  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.033632  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1633  phage-related baseplate assembly protein V  24.44 
 
 		 194 aa  41.6  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2603  phage baseplate assembly protein V  22.33 
 
 		 217 aa  41.6  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0154554  hitchhiker  0.000000000000278565 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2910  prophage MuMc02, baseplate assembly protein V  26.74 
 
 		 198 aa  41.2  0.01  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.625329  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>