20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2569 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_2569  hypothetical protein  100 
 
 
77 aa  163  9e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.650422 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1437  protein of unknown function DUF1271  64.86 
 
 
147 aa  99.4  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.781813  normal  0.13067 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2363  putative flavoprotein  48.48 
 
 
508 aa  76.3  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.547266  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1734  hypothetical protein  47.14 
 
 
76 aa  74.3  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2660  protein of unknown function DUF1271  42.25 
 
 
77 aa  62.4  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0741902  normal  0.253089 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4367  hypothetical protein  33.8 
 
 
76 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.325608  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4680  hypothetical protein  33.8 
 
 
76 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03997  hypothetical protein  33.8 
 
 
76 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3901  hypothetical protein  33.8 
 
 
76 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5641  hypothetical protein  33.8 
 
 
76 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03958  hypothetical protein  33.8 
 
 
76 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3866  protein of unknown function DUF1271  33.8 
 
 
76 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4594  hypothetical protein  33.8 
 
 
76 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3305  hypothetical protein  34.85 
 
 
76 aa  52.4  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2272  hypothetical protein  36.36 
 
 
211 aa  50.8  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0782  protein of unknown function DUF1271  41.79 
 
 
214 aa  50.1  0.000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0871  protein of unknown function DUF1271  40.62 
 
 
599 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.207432  normal  0.190699 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0824  hypothetical protein  36.11 
 
 
77 aa  48.9  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0714  hypothetical protein  31.34 
 
 
89 aa  48.5  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0385842  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0516  hypothetical protein  34.38 
 
 
211 aa  41.2  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>