18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1254 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1254  urease accessory protein  100 
 
 		 196 aa  387  1e-107  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.735612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3913  high-affinity nickel-transporter  31.91 
 
 		 238 aa  108  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3875  putative urease accessory protein  32.28 
 
 		 208 aa  84.7  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1153  high-affinity nickel-transporter  26.46 
 
 		 233 aa  83.6  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.608233 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2766  urease accessory protein  30.41 
 
 		 207 aa  82  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1851  high-affinity nickel-transporter  30.56 
 
 		 231 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0801332  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3876  high-affinity nickel-transporter  27.62 
 
 		 232 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5365  hypothetical protein  25.57 
 
 		 219 aa  72  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0923  high-affinity nickel-transporter  26.36 
 
 		 246 aa  68.2  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458788 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3212  high-affinity nickel-transporter  24.86 
 
 		 239 aa  63.9  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1392  hypothetical protein  26.99 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14951  hypothetical protein  28.81 
 
 		 223 aa  54.7  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.324822  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14811  hypothetical protein  28.19 
 
 		 223 aa  53.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.716818  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4480  hypothetical protein  26.34 
 
 		 231 aa  53.9  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.17724  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1750  hydrogenase accessory protein or high-affinity nickel-transport protein homolog, membrane protein  25 
 
 		 222 aa  51.2  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.1232  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3299  putative urease accessory protein  30.69 
 
 		 251 aa  47  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0670119  normal  0.289345 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04681  hypothetical protein  24.73 
 
 		 222 aa  47  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.668858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27426  P-ATPase family transporter: cadmium/zinc ion; heavy metal translocating P-type ATPase family-like protein  22.22 
 
 		 997 aa  41.2  0.01  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.040121  normal  0.339459 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>