More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1803 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_R0037  16S ribosomal RNA  87.16 
 
 
1497 bp  1370    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1275  16S ribosomal RNA  91.07 
 
 
1513 bp  1887    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1800  16S ribosomal RNA  100 
 
 
1511 bp  2995    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1704  16S ribosomal RNA  91.07 
 
 
1513 bp  1887    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1524  16S ribosomal RNA  91.07 
 
 
1513 bp  1887    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1724  16S ribosomal RNA  91.07 
 
 
1513 bp  1887    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.69789  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_Cj16SA  16S ribosomal RNA  91.13 
 
 
1513 bp  1895    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_Cj16SB  16S ribosomal RNA  91.13 
 
 
1513 bp  1895    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_Cj16SC  16S ribosomal RNA  91.13 
 
 
1513 bp  1895    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.334773  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0460  16S ribosomal RNA  90.73 
 
 
1513 bp  1848    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1806  16S ribosomal RNA  100 
 
 
1511 bp  2995    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0055  16S ribosomal RNA  87.23 
 
 
1497 bp  1378    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1465  16S ribosomal RNA  90.73 
 
 
1513 bp  1848    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0042  16S ribosomal RNA  87.16 
 
 
1497 bp  1370    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2339  16S ribosomal RNA  93.21 
 
 
1458 bp  2103    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.474601  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2336  16S ribosomal RNA  93.21 
 
 
1458 bp  2103    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2342  16S ribosomal RNA  93.21 
 
 
1458 bp  2103    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_r01  16S ribosomal RNA  93.4 
 
 
1723 bp  1901    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_r04  16S ribosomal RNA  93.4 
 
 
1723 bp  1901    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0018  16S ribosomal RNA  84.92 
 
 
1448 bp  872    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0022  16S ribosomal RNA  84.92 
 
 
1448 bp  872    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0031  16S ribosomal RNA  84.92 
 
 
1448 bp  872    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0059  16S ribosomal RNA  84.92 
 
 
1448 bp  872    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.578298  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_r06  16S ribosomal RNA  93.4 
 
 
1723 bp  1901    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0517  16S ribosomal RNA  90.73 
 
 
1513 bp  1848    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.635993  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1803  16S ribosomal RNA  100 
 
 
1511 bp  2995    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0148502  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0032  16S ribosomal RNA  91.07 
 
 
1513 bp  1887    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1711  16S ribosomal RNA  90.93 
 
 
1511 bp  1855    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0152  16S ribosomal RNA  91.79 
 
 
1461 bp  1917    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0506  16S ribosomal RNA  91.79 
 
 
1461 bp  1917    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.213034  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0592  16S ribosomal RNA  91.79 
 
 
1461 bp  1917    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.518963  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4281  16S ribosomal RNA  82.63 
 
 
1534 bp  363  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00173765  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4538  16S ribosomal RNA  82.63 
 
 
1534 bp  363  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00104444  hitchhiker  0.0000000000260436 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4374  16S ribosomal RNA  82.63 
 
 
1534 bp  363  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00157273  normal 
 
 
-
 
NC_002939  Gs16SA  16S ribosomal RNA  80.92 
 
 
1548 bp  359  2e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0695234  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  Gs16SB  16S ribosomal RNA  80.92 
 
 
1548 bp  359  2e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0572203  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2874  16S ribosomal RNA  82.63 
 
 
1534 bp  353  9e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0119912  normal  0.0940886 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4343  16S ribosomal RNA  82.63 
 
 
1534 bp  353  9e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000195321  normal  0.751071 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4267  16S ribosomal RNA  82.63 
 
 
1534 bp  353  9e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00203607  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0272  16S ribosomal RNA  82.63 
 
 
1534 bp  353  9e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000432735  normal  0.505563 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4314  16S ribosomal RNA  82.63 
 
 
1534 bp  353  9e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00481198  normal  0.279714 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0009  16S ribosomal RNA  82.38 
 
 
1538 bp  349  1e-93  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000102294  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0003  16S ribosomal RNA  82.38 
 
 
1537 bp  349  1e-93  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193245  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4116  16S ribosomal RNA  82.34 
 
 
1534 bp  347  5.999999999999999e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00638866  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2988  16S ribosomal RNA  82.34 
 
 
1534 bp  347  5.999999999999999e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000444401  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3763  16S ribosomal RNA  82.34 
 
 
1534 bp  347  5.999999999999999e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00234274  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0272  16S ribosomal RNA  82.34 
 
 
1534 bp  347  5.999999999999999e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.0079312  normal  0.924618 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4585  16S ribosomal RNA  82.34 
 
 
1534 bp  347  5.999999999999999e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000198793  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0288  16S ribosomal RNA  82.49 
 
 
1534 bp  345  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00456088  normal  0.440004 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0003  16S ribosomal RNA  82.23 
 
 
1538 bp  341  3.9999999999999995e-91  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011323  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0009  16S ribosomal RNA  82.23 
 
 
1538 bp  341  3.9999999999999995e-91  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000000361089  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3594  16S ribosomal RNA  82.19 
 
 
1534 bp  339  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000134897  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3666  16S ribosomal RNA  82.34 
 
 
1534 bp  337  6e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00014724  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4464  16S ribosomal RNA  82.34 
 
 
1534 bp  337  6e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00131676  hitchhiker  0.0000000000183145 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0291  16S ribosomal RNA  82.34 
 
 
1532 bp  337  6e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000859505  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2875  16S ribosomal RNA  82.34 
 
 
1534 bp  337  6e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000670664  normal  0.388962 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4511  16S ribosomal RNA  82.34 
 
 
1534 bp  337  6e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00904207  normal  0.512645 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2854  16S ribosomal RNA  82.34 
 
 
1534 bp  337  6e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00100225  normal  0.582574 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2770  16S ribosomal RNA  82.34 
 
 
1534 bp  337  6e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00496575  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4222  16S ribosomal RNA  82.34 
 
 
1534 bp  337  6e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00108755  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4172  16S ribosomal RNA  82.34 
 
 
1534 bp  337  6e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00219023  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4461  16S ribosomal RNA  82.34 
 
 
1534 bp  337  6e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00798027  hitchhiker  0.0013026 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0001  16S ribosomal RNA  82.38 
 
 
1535 bp  337  6e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000442431  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0004  16S ribosomal RNA  82.38 
 
 
1535 bp  337  6e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000248814  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0013  16S ribosomal RNA  82.38 
 
 
1535 bp  337  6e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000146432  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0027  16S ribosomal RNA  82.38 
 
 
1535 bp  337  6e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000222685  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0030  16S ribosomal RNA  82.38 
 
 
1535 bp  337  6e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000656968  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0061  16S ribosomal RNA  82.38 
 
 
1535 bp  337  6e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000486947  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0121  16S ribosomal RNA  82.38 
 
 
1535 bp  337  6e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000475957  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0128  16S ribosomal RNA  82.38 
 
 
1535 bp  337  6e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000157224  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0133  16S ribosomal RNA  82.38 
 
 
1535 bp  337  6e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000510938  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0277  16S ribosomal RNA  82.34 
 
 
1533 bp  337  6e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000147488  normal  0.265457 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0078  16S ribosomal RNA  82.28 
 
 
1530 bp  335  2e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000571707  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0064  16S ribosomal RNA  80.36 
 
 
1551 bp  335  2e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000106886  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0054  16S ribosomal RNA  80.36 
 
 
1551 bp  335  2e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000668462  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0021  16S ribosomal RNA  80.36 
 
 
1551 bp  335  2e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000868141  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0032  16S ribosomal RNA  80.36 
 
 
1551 bp  335  2e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00001675  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0009  16S ribosomal RNA  81.67 
 
 
1459 bp  331  3e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000834644  hitchhiker  0.00771881 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3084  16S ribosomal RNA  81.67 
 
 
1470 bp  331  3e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.448941  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0384  16S ribosomal RNA  81.67 
 
 
1470 bp  331  3e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.40156  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0052  16S ribosomal RNA  81.67 
 
 
1459 bp  331  3e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000233456  normal  0.528995 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4509  16S ribosomal RNA  82.19 
 
 
1534 bp  329  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00650936  normal  0.0273427 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4388  16S ribosomal RNA  82.19 
 
 
1534 bp  329  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00500579  normal  0.76733 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4195  16S ribosomal RNA  82.19 
 
 
1534 bp  329  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000110029  normal  0.531054 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4101  16S ribosomal RNA  82.19 
 
 
1534 bp  329  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000255406  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3700  16S ribosomal RNA  82.19 
 
 
1534 bp  329  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000788136  normal  0.0665123 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4218  16S ribosomal RNA  82.04 
 
 
1534 bp  321  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000122042  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3592  16S ribosomal RNA  82.04 
 
 
1533 bp  321  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000422776  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4124  16S ribosomal RNA  82.04 
 
 
1542 bp  321  3e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000130158  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4455  16S ribosomal RNA  82.04 
 
 
1542 bp  321  3e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000515772  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0009  16S ribosomal RNA  82.03 
 
 
1555 bp  319  9.999999999999999e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000407076  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0115  16S ribosomal RNA  82.03 
 
 
1555 bp  319  9.999999999999999e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000362636  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0123  16S ribosomal RNA  82.03 
 
 
1555 bp  319  9.999999999999999e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0112353  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0130  16S ribosomal RNA  82.03 
 
 
1555 bp  319  9.999999999999999e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0256321  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0005  16S ribosomal RNA  82.03 
 
 
1555 bp  319  9.999999999999999e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000520718  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0001  16S ribosomal RNA  82.03 
 
 
1555 bp  319  9.999999999999999e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000995354  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0021  16S ribosomal RNA  82.03 
 
 
1555 bp  319  9.999999999999999e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.267003  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_r00010  16S ribosomal RNA  82.86 
 
 
1542 bp  317  4.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00367496  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_r00017  16S ribosomal RNA  82.86 
 
 
1542 bp  317  4.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0241491  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0031  16S ribosomal RNA  82.86 
 
 
1534 bp  317  4.999999999999999e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00290684  decreased coverage  0.000000418388 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>