15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1895 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1895  hypothetical protein  100 
 
 
416 aa  823    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1098  hypothetical protein  41.75 
 
 
420 aa  284  2.0000000000000002e-75  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00466748  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2356  membrane protein-like protein  27.23 
 
 
442 aa  100  6e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00121464  hitchhiker  0.00000680633 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2229  membrane protein-like protein  31.4 
 
 
445 aa  80.1  0.00000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.196783  hitchhiker  0.00236837 
 
 
-
 
NC_004310  BR0896  hypothetical protein  31.13 
 
 
378 aa  77.4  0.0000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.555033  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2331  hypothetical protein  27.56 
 
 
376 aa  70.5  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2480  membrane protein  28.78 
 
 
370 aa  65.5  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.404247  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0892  hypothetical protein  34.31 
 
 
334 aa  62.8  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1595  hypothetical protein  23.08 
 
 
461 aa  60.1  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331924  normal  0.75872 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1086  membrane protein-like protein  27.16 
 
 
443 aa  58.2  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.166386  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2660  membrane protein-like protein  23.64 
 
 
431 aa  57.4  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4393  membrane protein  23.81 
 
 
436 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.153723  normal  0.326438 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2379  hypothetical protein  23.64 
 
 
478 aa  50.8  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0394731  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3664  hypothetical protein  26.06 
 
 
476 aa  46.2  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1503  conserved hypothetical conserved membrane protein  26.87 
 
 
367 aa  43.5  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>