More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_2341 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009707  JJD26997_1520  23S ribosomal RNA  93.35 
 
 
3084 bp  1850    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.614168  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1264  23S ribosomal RNA  93.35 
 
 
3084 bp  1850    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0052  23S ribosomal RNA  87.9 
 
 
2911 bp  2864    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0463  23S ribosomal RNA  93.57 
 
 
2891 bp  1901    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.815626  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0594  23S ribosomal RNA  94.07 
 
 
2781 bp  2302    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1798  23S ribosomal RNA  93.33 
 
 
2894 bp  1915    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_r05  23S ribosomal RNA  96.29 
 
 
3163 bp  2847    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2341  23S ribosomal RNA  100 
 
 
2888 bp  5725    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_Cj23SA  23S ribosomal RNA  93.58 
 
 
3063 bp  1873    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_Cj23SB  23S ribosomal RNA  93.58 
 
 
3063 bp  1873    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_Cj23SC  23S ribosomal RNA  93.58 
 
 
3063 bp  1873    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1714  23S ribosomal RNA  94.68 
 
 
2795 bp  1735    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1727  23S ribosomal RNA  94.77 
 
 
2796 bp  1750    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1707  23S ribosomal RNA  94.68 
 
 
2794 bp  1742    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0520  23S ribosomal RNA  93.57 
 
 
2891 bp  1901    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1462  23S ribosomal RNA  93.57 
 
 
2891 bp  1901    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0034  23S ribosomal RNA  87.9 
 
 
2911 bp  2864    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0039  23S ribosomal RNA  87.9 
 
 
2911 bp  2864    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0020  23S ribosomal RNA  88.92 
 
 
2884 bp  1235    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0024  23S ribosomal RNA  88.92 
 
 
2885 bp  1235    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0033  23S ribosomal RNA  88.92 
 
 
2884 bp  1235    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0057  23S ribosomal RNA  88.92 
 
 
2884 bp  1235    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.389269  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0508  23S ribosomal RNA  94.07 
 
 
2781 bp  2302    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0295614  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0154  23S ribosomal RNA  94.07 
 
 
2781 bp  2302    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0040  23S ribosomal RNA  93.35 
 
 
3045 bp  1850    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.339342  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1804  23S ribosomal RNA  93.33 
 
 
2894 bp  1915    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_r03  23S ribosomal RNA  96.29 
 
 
3163 bp  2847    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_r02  23S ribosomal RNA  96.29 
 
 
3163 bp  2847    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1801  23S ribosomal RNA  93.33 
 
 
2894 bp  1915    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.267192  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2338  23S ribosomal RNA  100 
 
 
2888 bp  5725    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2337  23S ribosomal RNA  100 
 
 
2888 bp  5725    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.49451  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0072  23S ribosomal RNA  88.26 
 
 
2907 bp  573  1e-160  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000119646  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0028  23S ribosomal RNA  88.26 
 
 
2908 bp  573  1e-160  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0063  23S ribosomal RNA  88.26 
 
 
2908 bp  573  1e-160  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0069  23S ribosomal RNA  88.26 
 
 
2908 bp  573  1e-160  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0069  23S ribosomal RNA  88.26 
 
 
2908 bp  573  1e-160  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0095  23S ribosomal RNA  88.26 
 
 
2908 bp  573  1e-160  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00287341  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0004  23S ribosomal RNA  88.26 
 
 
2908 bp  573  1e-160  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0011  23S ribosomal RNA  88.26 
 
 
2907 bp  573  1e-160  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0066  23S ribosomal RNA  88.26 
 
 
2907 bp  573  1e-160  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0141  23S ribosomal RNA  88.26 
 
 
2907 bp  573  1e-160  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.030132  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0091  23S ribosomal RNA  88.26 
 
 
2907 bp  573  1e-160  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109092  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0011  23S ribosomal RNA  88.26 
 
 
2908 bp  573  1e-160  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0004  23S ribosomal RNA  88.26 
 
 
2908 bp  573  1e-160  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0028  23S ribosomal RNA  88.26 
 
 
2907 bp  573  1e-160  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0016  23S ribosomal RNA  88.26 
 
 
2907 bp  573  1e-160  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.921086  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0060  23S ribosomal RNA  88.26 
 
 
2908 bp  573  1e-160  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0055  23S ribosomal RNA  88.26 
 
 
2907 bp  573  1e-160  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.940507  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0063  23S ribosomal RNA  88.26 
 
 
2908 bp  573  1e-160  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0055  23S ribosomal RNA  88.26 
 
 
2908 bp  573  1e-160  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0141246  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0072  23S ribosomal RNA  88.26 
 
 
2908 bp  573  1e-160  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0066  23S ribosomal RNA  88.26 
 
 
2908 bp  573  1e-160  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0145  23S ribosomal RNA  88.26 
 
 
2908 bp  573  1e-160  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0192013  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0075  23S ribosomal RNA  88.26 
 
 
2908 bp  573  1e-160  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0455984  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0348  23S ribosomal RNA  88.26 
 
 
2909 bp  573  1e-160  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0669786  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0016  23S ribosomal RNA  88.26 
 
 
2908 bp  573  1e-160  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.158063  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0031  23S ribosomal RNA  88.26 
 
 
2907 bp  573  1e-160  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000296907  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0060  23S ribosomal RNA  88.26 
 
 
2908 bp  573  1e-160  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0031  23S ribosomal RNA  88.26 
 
 
2908 bp  573  1e-160  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0455984  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5739  23S ribosomal RNA  88.07 
 
 
2908 bp  565  1e-158  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5748  23S ribosomal RNA  88.07 
 
 
2908 bp  565  1e-158  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.014193  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5751  23S ribosomal RNA  88.07 
 
 
2909 bp  565  1e-158  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5754  23S ribosomal RNA  88.07 
 
 
2909 bp  565  1e-158  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5757  23S ribosomal RNA  88.07 
 
 
2908 bp  565  1e-158  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5760  23S ribosomal RNA  88.07 
 
 
2908 bp  565  1e-158  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5763  23S ribosomal RNA  88.07 
 
 
2908 bp  565  1e-158  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5772  23S ribosomal RNA  88.07 
 
 
2926 bp  565  1e-158  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000735902  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-1  23S ribosomal RNA  88.07 
 
 
2911 bp  565  1e-158  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-10  23S ribosomal RNA  88.07 
 
 
2911 bp  565  1e-158  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-11  23S ribosomal RNA  88.07 
 
 
2911 bp  565  1e-158  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-2  23S ribosomal RNA  88.07 
 
 
2911 bp  565  1e-158  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-3  23S ribosomal RNA  88.07 
 
 
2851 bp  565  1e-158  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-4  23S ribosomal RNA  88.07 
 
 
2911 bp  565  1e-158  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-5  23S ribosomal RNA  88.07 
 
 
2911 bp  565  1e-158  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-6  23S ribosomal RNA  88.07 
 
 
2911 bp  565  1e-158  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  rRNA-23s-8  23S ribosomal RNA  88.07 
 
 
2911 bp  565  1e-158  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_1  23S ribosomal RNA  88.07 
 
 
2912 bp  565  1e-158  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_10  23S ribosomal RNA  88.07 
 
 
2912 bp  565  1e-158  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_11  23S ribosomal RNA  88.07 
 
 
2911 bp  565  1e-158  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_12  23S ribosomal RNA  88.07 
 
 
2911 bp  565  1e-158  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_13  23S ribosomal RNA  88.07 
 
 
2911 bp  565  1e-158  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_2  23S ribosomal RNA  88.07 
 
 
2911 bp  565  1e-158  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_3  23S ribosomal RNA  88.07 
 
 
2911 bp  565  1e-158  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_4  23S ribosomal RNA  88.07 
 
 
2911 bp  565  1e-158  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_5  23S ribosomal RNA  88.07 
 
 
2911 bp  565  1e-158  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.759228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_6  23S ribosomal RNA  88.07 
 
 
2911 bp  565  1e-158  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_7  23S ribosomal RNA  88.07 
 
 
2911 bp  565  1e-158  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_8  23S ribosomal RNA  88.07 
 
 
2911 bp  565  1e-158  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  rRNA-23SrRNA_9  23S ribosomal RNA  88.07 
 
 
2912 bp  565  1e-158  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_5  23S ribosomal RNA  88.07 
 
 
2911 bp  565  1e-158  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_8  23S ribosomal RNA  88.07 
 
 
2911 bp  565  1e-158  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  rRNA-23SrRNA_9  23S ribosomal RNA  88.07 
 
 
2912 bp  565  1e-158  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SA  23S ribosomal RNA  88.07 
 
 
2908 bp  565  1e-158  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.479202  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SB  23S ribosomal RNA  88.07 
 
 
2908 bp  565  1e-158  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SC  23S ribosomal RNA  88.07 
 
 
2908 bp  565  1e-158  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.948592  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SD  23S ribosomal RNA  88.07 
 
 
2908 bp  565  1e-158  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000431114  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SE  23S ribosomal RNA  88.07 
 
 
2908 bp  565  1e-158  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.842717  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SF  23S ribosomal RNA  88.07 
 
 
2908 bp  565  1e-158  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SH  23S ribosomal RNA  88.07 
 
 
2908 bp  565  1e-158  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  Ba23SJ  23S ribosomal RNA  88.07 
 
 
2908 bp  565  1e-158  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00026047  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>