51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1476 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1476  putative lipoprotein  100 
 
 
164 aa  327  4e-89  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0214  hypothetical protein  68.55 
 
 
160 aa  228  2e-59  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0087  hypothetical protein  43.1 
 
 
140 aa  90.5  9e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1507  hypothetical protein  41.67 
 
 
122 aa  78.6  0.00000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1577  ThiJ/PfpI  30.77 
 
 
209 aa  60.1  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.327807  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2641  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.36 
 
 
228 aa  57.4  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1835  ThiJ/PfpI  28.47 
 
 
228 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0689  transcriptional regulator  33.33 
 
 
297 aa  55.8  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1154  ThiJ/PfpI domain-containing protein  28.81 
 
 
234 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0937941 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1313  ThiJ/PfpI domain protein  28.81 
 
 
234 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0812761  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1849  ThiJ/PfpI domain protein  30.71 
 
 
225 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0641926  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0269  DJ-1/PfpI family protein  23.26 
 
 
232 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2525  isonitrile hydratase  23.26 
 
 
242 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0217881  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2666  isonitrile hydratase, putative  23.26 
 
 
242 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1611  DJ-1/PfpI family protein  23.26 
 
 
232 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1415  DJ-1/PfpI family protein  23.26 
 
 
242 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0232  DJ-1/PfpI family protein  23.26 
 
 
232 aa  53.9  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1581  ThiJ/PfpI domain-containing protein  27.56 
 
 
193 aa  52  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.816456  normal  0.183616 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0514  DJ-1/PfpI family protein  24.41 
 
 
238 aa  51.6  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2623  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.36 
 
 
242 aa  49.7  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3318  ThiJ/PfpI domain-containing protein  26.92 
 
 
224 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.47928  normal  0.652911 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0954  DJ-1/PfpI family protein  23.26 
 
 
691 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3642  ThiJ/PfpI domain protein  26.15 
 
 
224 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.667474  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2581  AraC family transcriptional regulator  26.02 
 
 
198 aa  48.1  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.898766  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2087  ThiJ/PfpI domain protein  27.2 
 
 
199 aa  47  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0785753  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4181  ThiJ/PfpI domain-containing protein  24.81 
 
 
234 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3686  ThiJ/PfpI domain-containing protein  24.81 
 
 
239 aa  47  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4063  ThiJ/PfpI domain-containing protein  24.81 
 
 
234 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2164  ThiJ/PfpI domain protein  27.08 
 
 
202 aa  46.2  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000571514 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2887  ThiJ/PfpI  25.85 
 
 
233 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00139108  normal  0.0511878 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2656  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.91 
 
 
198 aa  46.6  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102982  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3530  ThiJ/PfpI domain-containing protein  29.37 
 
 
207 aa  45.8  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3444  ThiJ/PfpI domain-containing protein  22.69 
 
 
188 aa  45.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1653  ThiJ/PfpI domain-containing protein  25.26 
 
 
240 aa  44.3  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.187677 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2901  transcriptional regulator, AraC family; protease  28.26 
 
 
197 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2700  ThiJ/PfpI domain protein  23.65 
 
 
229 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0269047  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3518  ThiJ/PfpI domain protein  27.35 
 
 
226 aa  43.5  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3031  ThiJ/PfpI  24.16 
 
 
234 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.140928  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2427  transcriptional regulator, AraC family  29.35 
 
 
198 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.424893 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1644  transcriptional regulator  25.42 
 
 
220 aa  43.9  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2626  ThiJ/PfpI domain-containing protein  28.35 
 
 
199 aa  43.5  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.618286  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5674  ThiJ/PfpI domain protein  23.73 
 
 
212 aa  43.5  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2687  ThiJ/PfpI domain-containing protein  21.43 
 
 
227 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2047  ThiJ/PfpI  21.43 
 
 
227 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2658  ThiJ/PfpI domain-containing protein  21.43 
 
 
227 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.152452  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0492  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.33 
 
 
231 aa  42.4  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4460  ThiJ/PfpI domain protein  21.18 
 
 
243 aa  42  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.322473  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1495  ThiJ/PfpI domain-containing protein  23.39 
 
 
199 aa  41.6  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2879  ThiJ/PfpI  26.89 
 
 
201 aa  41.6  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4082  ThiJ/PfpI domain-containing protein  26.24 
 
 
237 aa  40.8  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2883  hypothetical protein  27.37 
 
 
198 aa  40.4  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00738999  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>