20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_11283 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_11283  hypothetical protein  100 
 
 		 157 aa  327  3e-89  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2919  hypothetical protein  61.49 
 
 		 150 aa  204  5e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0461  protein of unknown function DUF450  59.18 
 
 		 151 aa  191  4e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1250  protein of unknown function DUF450  44.74 
 
 		 153 aa  148  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344127  normal  0.355238 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2421  hypothetical protein  45.21 
 
 		 149 aa  134  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0367  protein of unknown function DUF450  41.1 
 
 		 147 aa  134  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1807  protein of unknown function DUF450  38.57 
 
 		 155 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.648369  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1526  hypothetical protein  37.67 
 
 		 147 aa  121  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0947  hypothetical protein  37.67 
 
 		 157 aa  117  4.9999999999999996e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.138847 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1440  hypothetical protein  37.84 
 
 		 150 aa  116  9.999999999999999e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0314502 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1997  hypothetical protein  39.31 
 
 		 153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.602418 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0838  hypothetical protein  37.98 
 
 		 418 aa  87.8  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.174927  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0324  N-6 DNA methylase  32.77 
 
 		 657 aa  58.5  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00528654  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0754  hypothetical protein  27.85 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.774812  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3600  N-6 DNA methylase  34.34 
 
 		 738 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20400  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  25.9 
 
 		 654 aa  44.7  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0518055 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0809  LexA repressor  26.9 
 
 		 815 aa  43.9  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.642499  hitchhiker  0.0000861607 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0689  DNA methylase-type I restriction-modification system  31.73 
 
 		 687 aa  43.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1224  N-6 DNA methylase  27.48 
 
 		 796 aa  43.5  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.708606 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3247  N-6 DNA methylase  35.16 
 
 		 748 aa  40.8  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>