21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_00805 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_00805  hypothetical protein  100 
 
 
172 aa  346  8e-95  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.277049  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1853  hypothetical protein  59.57 
 
 
169 aa  177  9e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4922  hypothetical protein  48.62 
 
 
180 aa  170  9e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5956  hypothetical protein  37.59 
 
 
191 aa  85.9  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0211287  normal  0.0139937 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0853  hypothetical protein  31.06 
 
 
216 aa  80.1  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0265193 
 
 
-
 
NC_002950  PG0336  hypothetical protein  29.55 
 
 
189 aa  72.8  0.000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.625981 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3702  hypothetical protein  29.03 
 
 
200 aa  60.5  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009433  Rsph17025_4396  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  29.03 
 
 
200 aa  60.5  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0736  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  29.68 
 
 
200 aa  59.3  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0745  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  26.14 
 
 
211 aa  51.2  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2989  plasmid pRiA4b ORF-3-like  22.09 
 
 
198 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.176424  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1350  hypothetical protein  20.23 
 
 
188 aa  44.3  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0718153  normal  0.422526 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1348  hypothetical protein  23.87 
 
 
189 aa  42.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.244032  normal  0.420719 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0351  hypothetical protein  25.77 
 
 
200 aa  43.5  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1544  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  20.55 
 
 
390 aa  42.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.170767 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1826  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  23.38 
 
 
233 aa  41.6  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0548  hypothetical protein  26.88 
 
 
212 aa  41.2  0.006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1222  hypothetical protein  25.33 
 
 
200 aa  41.2  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0186  hypothetical protein  25.33 
 
 
200 aa  41.2  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2928  plasmid pRiA4b ORF-3 family protein  24.48 
 
 
197 aa  41.2  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4772  hypothetical protein  25.18 
 
 
645 aa  40.8  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0021908 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>