22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0505 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0505  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  273  6e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.100148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6460  Cupin 2 conserved barrel domain protein  54.62 
 
 		 132 aa  147  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0171538  hitchhiker  0.000000529343 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5282  hypothetical protein  44.76 
 
 		 191 aa  99.4  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.274603 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3363  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.7 
 
 		 140 aa  95.5  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1401  hypothetical protein  48.08 
 
 		 133 aa  95.5  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1841  cupin 2, barrel  41.41 
 
 		 141 aa  95.1  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0498378 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2942  hypothetical protein  41.96 
 
 		 144 aa  94.7  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6897  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.07 
 
 		 144 aa  92.8  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.800776  normal  0.40787 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4216  cupin 2 domain-containing protein  43.31 
 
 		 138 aa  92.4  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.014913 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1567  hypothetical protein  42.74 
 
 		 140 aa  91.7  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1216  cupin 2 domain-containing protein  38.81 
 
 		 145 aa  91.7  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.365458  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2754  cupin 2 domain-containing protein  42.48 
 
 		 141 aa  90.5  7e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.151097 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0625  cupin 2 domain-containing protein  43.69 
 
 		 151 aa  88.6  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00815435 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0701  cupin 2 domain-containing protein  39.32 
 
 		 141 aa  88.2  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.608661 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2367  hypothetical protein  38.4 
 
 		 144 aa  85.1  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.577514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3793  cupin 2 domain-containing protein  39.32 
 
 		 144 aa  84  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.742443  normal  0.0537176 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3728  cupin 2 domain-containing protein  39.32 
 
 		 144 aa  84  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0858246 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4635  cupin 2, barrel  39.32 
 
 		 144 aa  84  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3610  cupin 2 domain-containing protein  37.82 
 
 		 144 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5798  cupin 2 domain-containing protein  45.22 
 
 		 150 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5791  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.86 
 
 		 150 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0939  hypothetical protein  33.33 
 
 		 266 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>