13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0446 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0446  hypothetical protein  100 
 
 
192 aa  388  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.647617  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0159  hypothetical protein  78.57 
 
 
194 aa  296  1e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2659  hypothetical protein  67.54 
 
 
191 aa  268  2.9999999999999997e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6508  hypothetical protein  71.02 
 
 
191 aa  262  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1752  hypothetical protein  71.1 
 
 
191 aa  259  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.707252  normal  0.667908 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5090  hypothetical protein  62.3 
 
 
173 aa  86.7  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4350  hypothetical protein  54.17 
 
 
172 aa  81.6  0.000000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0673  hypothetical protein  67.92 
 
 
178 aa  80.9  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4927  hypothetical protein  46.74 
 
 
177 aa  80.1  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5040  putative secreted protein  49.32 
 
 
212 aa  72  0.000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0874  hypothetical protein  34.19 
 
 
186 aa  61.6  0.000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6493  hypothetical protein  52.83 
 
 
171 aa  59.7  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6220  hypothetical protein  37.35 
 
 
181 aa  42  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.29457 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>