12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0445 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0445  hypothetical protein  100 
 
 
286 aa  577  1e-164  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.122725  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0158  hypothetical protein  59.86 
 
 
290 aa  315  4e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6343  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.08 
 
 
286 aa  73.2  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.460291 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0782  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.68 
 
 
281 aa  58.9  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000350722 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5812  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.42 
 
 
262 aa  49.3  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4305  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.81 
 
 
360 aa  47.8  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0467548  normal 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2257  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.98 
 
 
359 aa  47.4  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.69947  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6445  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.09 
 
 
360 aa  46.2  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.67633  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6602  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.37 
 
 
358 aa  45.8  0.0009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4974  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.67 
 
 
282 aa  45.4  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3194  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.86 
 
 
249 aa  43.5  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0014  putative ParA-like (IncC) ATPase  26.49 
 
 
294 aa  43.1  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.118002 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>