13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2925 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2925  hypothetical protein  100 
 
 		 278 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6880  TadE family protein  83.09 
 
 		 278 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.737153  normal  0.128629 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4350  TadE family protein  55.69 
 
 		 260 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2304  TadE family protein  45.66 
 
 		 264 aa  142  7e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.386947  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0713  hypothetical protein  36.44 
 
 		 228 aa  135  5e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2301  hypothetical protein  46.34 
 
 		 250 aa  133  3e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.568137  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2294  TadE family protein  46.24 
 
 		 280 aa  132  5e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0743  hypothetical protein  34.82 
 
 		 233 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0639  hypothetical protein  32.76 
 
 		 215 aa  128  9.000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0253  TadE family protein  35.29 
 
 		 336 aa  110  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.148755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2111  TadE family protein  34.68 
 
 		 237 aa  95.1  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2698  TadE family protein  29.32 
 
 		 342 aa  55.8  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.196743  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2929  TadE family protein  38.89 
 
 		 129 aa  44.3  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.197954  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>