90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2560 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008544  Bcen2424_6086  MlrC domain-containing protein  79.11 
 
 
500 aa  749    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4481  hypothetical protein  65.2 
 
 
497 aa  656    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.313264  normal  0.0111943 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2560  hypothetical protein  100 
 
 
496 aa  1009    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6568  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  92.94 
 
 
496 aa  932    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.102219  hitchhiker  0.00991258 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5859  MlrC domain-containing protein  78.25 
 
 
500 aa  764    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0807432  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1587  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  66.39 
 
 
490 aa  689    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6569  MlrC domain-containing protein  78.46 
 
 
492 aa  716    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0911835 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7545  hypothetical protein  79.72 
 
 
500 aa  761    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.525505 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6029  MlrC domain-containing protein  64.62 
 
 
488 aa  650    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3825  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  66.6 
 
 
492 aa  643    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4902  MlrC domain protein  66.6 
 
 
492 aa  643    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6097  MlrC domain-containing protein  79.27 
 
 
500 aa  746    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3464  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  61.55 
 
 
488 aa  621  1e-177  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5722  MlrC-like  79.29 
 
 
403 aa  593  1e-168  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4756  MlrC domain-containing protein  63.67 
 
 
491 aa  594  1e-168  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6012  MlrC domain-containing protein  79.89 
 
 
376 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4259  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  56.25 
 
 
494 aa  520  1e-146  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0762  MlrC domain-containing protein  56.05 
 
 
495 aa  499  1e-140  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4266  MlrC domain-containing protein  51.92 
 
 
494 aa  489  1e-137  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5513  hypothetical protein  48.59 
 
 
500 aa  448  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.142983  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6004  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  41.85 
 
 
498 aa  351  2e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3774  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  37.28 
 
 
510 aa  280  3e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4364  MlrC domain-containing protein  32.46 
 
 
527 aa  247  3e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1221  MlrC-like protein  35.28 
 
 
515 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1343  hypothetical protein  35.04 
 
 
503 aa  237  4e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.99178  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1322  MlrC-like  31.63 
 
 
502 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1406  MlrC domain protein  32.52 
 
 
501 aa  224  4e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.513277  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02129  hypothetical protein  34.36 
 
 
494 aa  223  7e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1194  MlrC-like  33.54 
 
 
506 aa  220  6e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5259  hypothetical protein  34.24 
 
 
508 aa  219  7.999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.303674  normal  0.119677 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6696  MlrC domain-containing protein  35.26 
 
 
516 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380742  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2627  MlrC domain-containing protein  32.53 
 
 
503 aa  207  3e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.751355  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0684  hypothetical protein  30.18 
 
 
491 aa  207  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3013  MlrC domain-containing protein  33.47 
 
 
515 aa  205  2e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.784284 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0897  microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  31.38 
 
 
490 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.14771 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0397  MlrC-like  30.77 
 
 
499 aa  199  7.999999999999999e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7649  MlrC domain-containing protein  34.18 
 
 
498 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.428726  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6174  MlrC domain protein  32.43 
 
 
505 aa  199  9e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.697276  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1296  MlrC C-terminus family protein  32.08 
 
 
502 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2942  MlrC domain-containing protein  32.08 
 
 
511 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1369  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  30.94 
 
 
487 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.504048  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0874  microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  31.17 
 
 
487 aa  195  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4349  hypothetical protein  31.61 
 
 
488 aa  195  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3815  MlrC-like  33.33 
 
 
500 aa  194  4e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0503052 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2255  MlrC C-terminus family protein  33.54 
 
 
525 aa  191  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3068  MlrC domain-containing protein  32.1 
 
 
511 aa  190  4e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.295091  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3899  hypothetical protein  29.94 
 
 
489 aa  189  9e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1696  hypothetical protein  29.62 
 
 
493 aa  187  3e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3885  hypothetical protein  32.6 
 
 
498 aa  187  4e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0702  hypothetical protein  29.84 
 
 
489 aa  186  1.0000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.104347  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4155  MlrC domain-containing protein  32.19 
 
 
498 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.870407 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0752  hypothetical protein  29.64 
 
 
489 aa  183  6e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.256842  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1621  hypothetical protein  29.62 
 
 
491 aa  183  6e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0947431  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6252  hypothetical protein  31.24 
 
 
488 aa  182  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.179737  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1557  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  29.52 
 
 
483 aa  182  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.138182  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4654  MlrC domain-containing protein  30.08 
 
 
477 aa  181  4e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.464833  normal  0.119732 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4101  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  28.34 
 
 
480 aa  178  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3571  Microcystin LR degradation protein MlrC  28.57 
 
 
488 aa  177  3e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.105473 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1660  hypothetical protein  27.41 
 
 
552 aa  177  3e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1868  hypothetical protein  29.4 
 
 
491 aa  178  3e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.720764  normal  0.0278927 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5087  hypothetical protein  30.54 
 
 
482 aa  177  4e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00418234  normal  0.445331 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4633  hypothetical protein  28.46 
 
 
500 aa  176  7e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0253146  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3378  MlrC domain-containing protein  33.89 
 
 
515 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0192331  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2285  MlrC C-terminus family protein  32.78 
 
 
512 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.887677  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1326  MlrC C-terminus family protein  33.4 
 
 
518 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3711  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  27.6 
 
 
482 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21787  hitchhiker  0.00970232 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3102  MlrC domain-containing protein  33.4 
 
 
518 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.328821  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2977  MlrC domain-containing protein  33.4 
 
 
512 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3979  MlrC-like  29.7 
 
 
494 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1459  Microcystin LR degradation protein MlrC  31.52 
 
 
498 aa  174  3.9999999999999995e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1929  MlrC domain-containing protein  28.63 
 
 
507 aa  173  5e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.432172 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2751  hypothetical protein  29.49 
 
 
488 aa  172  1e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00233785  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3778  MlrC domain protein  26.52 
 
 
488 aa  171  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6013  hypothetical protein  78.07 
 
 
143 aa  167  5e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6244  hypothetical protein  28.94 
 
 
434 aa  165  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3799  MlrC domain-containing protein  30.28 
 
 
499 aa  165  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.124287 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4648  hypothetical protein  27.89 
 
 
497 aa  161  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.381889  normal  0.0618812 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4334  MlrC domain-containing protein  28.03 
 
 
489 aa  154  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.67984  normal  0.0960828 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6625  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  26.72 
 
 
491 aa  155  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0548728  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1346  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  28.6 
 
 
523 aa  154  5e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.27554 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5682  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  26.96 
 
 
491 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4776  MlrC domain-containing protein  28.91 
 
 
489 aa  151  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.76631  hitchhiker  0.00013029 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5236  putative microcystin LR degradation protein MlrC  27.63 
 
 
519 aa  139  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.781031  hitchhiker  0.000000241769 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0130  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  25.65 
 
 
524 aa  139  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.713091 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1428  hypothetical protein  29.33 
 
 
510 aa  137  5e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00996809 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4051  Microcystin LR degradation protein MlrC  29.58 
 
 
524 aa  133  7.999999999999999e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1258  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  29.8 
 
 
561 aa  130  5.0000000000000004e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.367829  normal  0.015953 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1717  Microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  28.8 
 
 
482 aa  130  5.0000000000000004e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.679786  normal  0.126006 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3062  microcystin LR degradation protein MlrC-like protein  29.92 
 
 
500 aa  105  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.954396  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00790  hypothetical protein  26.9 
 
 
509 aa  105  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>