60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2708 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2763  putative transposase IS110  100 
 
 		 1263 bp  1076    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0156  putative transposase  100 
 
 		 1263 bp  1076    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3480  putative transposase  100 
 
 		 1263 bp  1076    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2708    100 
 
 		 579 bp  1148    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.305668 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0103  putative transposase  91.51 
 
 		 738 bp  632  1e-179  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7787    86.37 
 
 		 1261 bp  430  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.511104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1387  transposase  85.01 
 
 		 1263 bp  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2615  transposase  85.01 
 
 		 1263 bp  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0243344  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1289  transposase  85.01 
 
 		 1263 bp  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1964  transposase  85.01 
 
 		 1263 bp  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.366861  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0642  transposase  85.01 
 
 		 1263 bp  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0735  transposase  85.01 
 
 		 1263 bp  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.924644  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6212  transposase IS116/IS110/IS902  82.59 
 
 		 1263 bp  325  8e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4744  transposase IS116/IS110/IS902  82.59 
 
 		 1263 bp  325  8e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1195  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  82.59 
 
 		 1263 bp  325  8e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4714  transposase IS116/IS110/IS902  82.59 
 
 		 1263 bp  325  8e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1867  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  82.59 
 
 		 1263 bp  325  8e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3649  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  82.59 
 
 		 1263 bp  325  8e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.229157  normal  0.577395 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0354  transposase IS116/IS110/IS902  82.59 
 
 		 1263 bp  325  8e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.473452  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0716  transposase IS116/IS110/IS902  82.59 
 
 		 1263 bp  325  8e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.31796  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2516  transposase IS116/IS110/IS902  82.59 
 
 		 1263 bp  325  8e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2654  transposase IS116/IS110/IS902  82.59 
 
 		 1263 bp  325  8e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3689  transposase IS116/IS110/IS902  82.59 
 
 		 1263 bp  325  8e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.767433  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5636  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  83.1 
 
 		 1206 bp  319  5e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1190  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  83.1 
 
 		 1206 bp  319  5e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140816  normal  0.0159286 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1545  ISBma3, transposase  82.22 
 
 		 1263 bp  309  5.0000000000000004e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3194  ISBma3, transposase  82.22 
 
 		 1263 bp  309  5.0000000000000004e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2836  ISBma3, transposase  82.22 
 
 		 1263 bp  309  5.0000000000000004e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1755  ISBma3, transposase  82.22 
 
 		 1263 bp  309  5.0000000000000004e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00342149  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1754  ISBma3, transposase  82.22 
 
 		 1263 bp  309  5.0000000000000004e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0534372  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0480    81.85 
 
 		 1224 bp  276  7e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1893  transposase  81.22 
 
 		 1281 bp  268  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0576    81.26 
 
 		 1293 bp  252  1e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0983085  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1413    82.2 
 
 		 467 bp  210  3e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5595  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  84.34 
 
 		 336 bp  184  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.958952 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5264  transposase IS116/IS110/IS902  83.94 
 
 		 336 bp  176  5e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0312  transposase  89.61 
 
 		 1197 bp  89.7  8e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0142  transposase  89.61 
 
 		 1197 bp  89.7  8e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.784062  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4876  transposase  89.61 
 
 		 1197 bp  89.7  8e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4033  transposase  89.61 
 
 		 1197 bp  89.7  8e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3846  transposase  89.61 
 
 		 1197 bp  89.7  8e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3346  transposase  89.61 
 
 		 1197 bp  89.7  8e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2865  transposase  89.61 
 
 		 1197 bp  89.7  8e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2725  transposase  89.61 
 
 		 1197 bp  89.7  8e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2541  transposase  89.61 
 
 		 1197 bp  89.7  8e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0777967  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1992  transposase  89.61 
 
 		 1197 bp  89.7  8e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.546603  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1953  transposase  89.61 
 
 		 1197 bp  89.7  8e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1104  transposase  89.61 
 
 		 1197 bp  89.7  8e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1103    89.61 
 
 		 2017 bp  89.7  8e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0273  transposase  89.61 
 
 		 1197 bp  89.7  8e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0230  transposase  89.61 
 
 		 1197 bp  89.7  8e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2442    100 
 
 		 333 bp  73.8  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.648718  normal  0.271346 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3173  hypothetical protein  100 
 
 		 714 bp  71.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3749  hypothetical protein  100 
 
 		 387 bp  71.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.424786  normal  0.548735 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1751    83.15 
 
 		 801 bp  58  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0183737  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0847  ISBma3, transposase, truncation  83.15 
 
 		 801 bp  58  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0890    83.15 
 
 		 801 bp  58  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.120752  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2204    83.15 
 
 		 801 bp  58  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6332    92.31 
 
 		 447 bp  54  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1982    93.94 
 
 		 261 bp  50.1  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.268441  normal  0.248376 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>