13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A0774 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A0774  hypothetical protein  100 
 
 
586 aa  1170    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1202  Pyrrolo-quinoline quinone  80.44 
 
 
574 aa  837    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.142183  normal  0.254768 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6636  Pyrrolo-quinoline quinone  64 
 
 
577 aa  660    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.179451  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3192  hypothetical protein  93.07 
 
 
596 aa  959    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0105829  normal  0.184057 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1484  hypothetical protein  44.91 
 
 
1128 aa  360  4e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.848457  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4776  hypothetical protein  40.75 
 
 
841 aa  327  4.0000000000000003e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.174765  normal  0.0133719 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1628  hypothetical protein  40.35 
 
 
612 aa  311  1e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1148  Ig-like, group 2  40.67 
 
 
683 aa  305  2.0000000000000002e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.828314  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1154  hypothetical protein  31.65 
 
 
727 aa  213  1e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00101932  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2697  legume lectin beta domain protein  32.09 
 
 
1236 aa  176  9e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0132334  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6412  Pyrrolo-quinoline quinone  30.44 
 
 
1192 aa  147  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.152468 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0402  Pyrrolo-quinoline quinone  26.37 
 
 
531 aa  67  0.0000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8051  Pyrrolo-quinoline quinone  25.77 
 
 
434 aa  58.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.761196  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>