16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4756 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4756  putative outer membrane protein  100 
 
 		 308 aa  620  1e-177  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.290345 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1330  putative outer membrane protein  33.33 
 
 		 277 aa  122  7e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.428976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4195  putative outer membrane protein  30.8 
 
 		 282 aa  122  8e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0996091 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2761  putative outer membrane protein  34.24 
 
 		 279 aa  119  7.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0909  MltA-interacting MipA family protein  33.73 
 
 		 304 aa  112  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2703  putative outer membrane protein  25.74 
 
 		 265 aa  90.1  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00728631 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0015  MltA-interacting MipA  24.65 
 
 		 279 aa  80.5  0.00000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0046334  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4564  MltA-interacting MipA  29.09 
 
 		 497 aa  57.4  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.672306  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1315  MltA-interacting MipA  25.19 
 
 		 261 aa  51.2  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00759705  normal  0.297084 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1724  hypothetical protein  24.69 
 
 		 267 aa  47.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3818  MltA-interacting MipA family protein  36.04 
 
 		 491 aa  47.4  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.217348  normal  0.980819 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2733  outer membrane protein  26.16 
 
 		 272 aa  45.8  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.244653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1748  MltA-interacting MipA family protein  26.11 
 
 		 242 aa  45.4  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0833068  normal  0.105882 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4081  MltA-interacting MipA family protein  26.58 
 
 		 271 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3569  MltA-interacting MipA  22.55 
 
 		 292 aa  44.3  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000215128  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3438  MltA-interacting MipA family protein  26.16 
 
 		 271 aa  43.9  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>