24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6897 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6897  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 144 aa  303  7e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.800776  normal  0.40787 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2942  hypothetical protein  96.53 
 
 		 144 aa  293  4e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2367  hypothetical protein  80.56 
 
 		 144 aa  248  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.577514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4635  cupin 2, barrel  79.17 
 
 		 144 aa  246  7e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3728  cupin 2 domain-containing protein  79.17 
 
 		 144 aa  246  7e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0858246 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3793  cupin 2 domain-containing protein  79.17 
 
 		 144 aa  246  7e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.742443  normal  0.0537176 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3610  cupin 2 domain-containing protein  79.17 
 
 		 144 aa  245  1e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0701  cupin 2 domain-containing protein  73.19 
 
 		 141 aa  224  3e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.608661 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1841  cupin 2, barrel  77.44 
 
 		 141 aa  222  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0498378 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3363  Cupin 2 conserved barrel domain protein  75.54 
 
 		 140 aa  219  9e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2754  cupin 2 domain-containing protein  75 
 
 		 141 aa  219  9e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.151097 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1567  hypothetical protein  70.5 
 
 		 140 aa  219  9.999999999999999e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4216  cupin 2 domain-containing protein  72.18 
 
 		 138 aa  213  9.999999999999999e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.014913 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1216  cupin 2 domain-containing protein  69.63 
 
 		 145 aa  197  3e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.365458  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0625  cupin 2 domain-containing protein  63.24 
 
 		 151 aa  185  2e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00815435 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5282  hypothetical protein  40.16 
 
 		 191 aa  95.1  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.274603 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0505  hypothetical protein  41.07 
 
 		 133 aa  92.8  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.100148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6460  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.07 
 
 		 132 aa  85.5  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0171538  hitchhiker  0.000000529343 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5798  cupin 2 domain-containing protein  33.09 
 
 		 150 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5791  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.88 
 
 		 150 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1401  hypothetical protein  35.16 
 
 		 133 aa  70.1  0.000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0939  hypothetical protein  32.81 
 
 		 266 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.21 
 
 		 126 aa  43.9  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.539282  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7188  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.32 
 
 		 152 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>