38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5312 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5312  hypothetical protein  100 
 
 
71 aa  137  6e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.50435  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1296  hypothetical protein  91.55 
 
 
71 aa  128  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00854163  normal  0.417956 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3137  hypothetical protein  77.46 
 
 
70 aa  107  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0896468  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3174  hypothetical protein  59.32 
 
 
66 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3339  hypothetical protein  54.24 
 
 
66 aa  69.7  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4937  hypothetical protein  52.38 
 
 
67 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.185526 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2952  hypothetical protein  50 
 
 
68 aa  66.2  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4891  hypothetical protein  54.24 
 
 
67 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.855496 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2869  hypothetical protein  53.45 
 
 
67 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.134016  normal  0.504721 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4427  hypothetical protein  54.24 
 
 
67 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.565322 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1419  hypothetical protein  55.81 
 
 
65 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.279889  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2433  hypothetical protein  34.72 
 
 
77 aa  57  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.517963  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0595  hypothetical protein  44.07 
 
 
65 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0617  hypothetical protein  42.37 
 
 
65 aa  55.1  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0761  hypothetical protein  42.37 
 
 
65 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000272187 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0835  hypothetical protein  43.1 
 
 
65 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0673  hypothetical protein  43.1 
 
 
65 aa  53.9  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0707  hypothetical protein  43.1 
 
 
65 aa  53.9  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0617  hypothetical protein  43.1 
 
 
65 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.041251  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0776  hypothetical protein  41.38 
 
 
65 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0741  hypothetical protein  37.29 
 
 
65 aa  52  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129654  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4596  hypothetical protein  37.29 
 
 
65 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0411929  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0622  hypothetical protein  37.93 
 
 
65 aa  49.7  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2390  hypothetical protein  32.81 
 
 
72 aa  47  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1446  hypothetical protein  44.44 
 
 
68 aa  46.6  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.55376  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3820  hypothetical protein  40.91 
 
 
59 aa  45.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0432882  normal  0.337677 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3933  hypothetical protein  40.91 
 
 
59 aa  45.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.174427 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2735  hypothetical protein  40.91 
 
 
94 aa  46.2  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0019188  normal  0.0797961 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3557  hypothetical protein  37.5 
 
 
69 aa  44.7  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.121264  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5755  hypothetical protein  38.46 
 
 
97 aa  44.3  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0759  hypothetical protein  36.21 
 
 
88 aa  43.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.864504  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6668  hypothetical protein  31.75 
 
 
69 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.297538  normal  0.224588 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0075  hypothetical protein  44 
 
 
66 aa  43.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.398237  normal  0.423709 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5821  hypothetical protein  46.94 
 
 
65 aa  43.5  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4361  hypothetical protein  33.9 
 
 
69 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.359787 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0959  hypothetical protein  33.96 
 
 
79 aa  41.6  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.134343  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4493  hypothetical protein  42.22 
 
 
101 aa  41.2  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1983  hypothetical protein  32.79 
 
 
68 aa  40.8  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>