39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3820 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_3933  hypothetical protein  100 
 
 		 59 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.174427 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3820  hypothetical protein  100 
 
 		 59 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0432882  normal  0.337677 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5821  hypothetical protein  71.43 
 
 		 65 aa  76.3  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6400  hypothetical protein  61.11 
 
 		 65 aa  75.1  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.916024  normal  0.116761 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0075  hypothetical protein  63.64 
 
 		 66 aa  73.2  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.398237  normal  0.423709 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4526  hypothetical protein  61.11 
 
 		 65 aa  72  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.823764 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4493  hypothetical protein  67.35 
 
 		 101 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0790  hypothetical protein  65.31 
 
 		 65 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.185376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4478  hypothetical protein  67.35 
 
 		 65 aa  70.9  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3901  hypothetical protein  65.31 
 
 		 65 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1446  hypothetical protein  56 
 
 		 68 aa  66.6  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.55376  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3322  hypothetical protein  48.21 
 
 		 79 aa  57  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.443037  normal  0.594787 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1224  hypothetical protein  46.55 
 
 		 81 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2025  hypothetical protein  64.1 
 
 		 58 aa  55.5  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2108  hypothetical protein  50.98 
 
 		 74 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.22897 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2470  hypothetical protein  47.92 
 
 		 112 aa  53.5  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0836129 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2257  hypothetical protein  53.19 
 
 		 80 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0271155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2361  hypothetical protein  53.19 
 
 		 80 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2338  hypothetical protein  53.19 
 
 		 80 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2377  hypothetical protein  53.19 
 
 		 80 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.809061  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1726  hypothetical protein  53.19 
 
 		 80 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.1373  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1358  hypothetical protein  43.18 
 
 		 131 aa  53.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.92446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0939  hypothetical protein  45.28 
 
 		 77 aa  51.2  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.02047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5681  hypothetical protein  51.06 
 
 		 80 aa  51.2  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.150981  normal  0.858407 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1571  hypothetical protein  51.16 
 
 		 83 aa  50.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.665593 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0293  hypothetical protein  45.45 
 
 		 79 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.984016  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1171  hypothetical protein  45.45 
 
 		 79 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0222478  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1163  hypothetical protein  45.45 
 
 		 79 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0855  hypothetical protein  45.45 
 
 		 79 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1010  hypothetical protein  45.45 
 
 		 79 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.652393  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1322  hypothetical protein  45.45 
 
 		 79 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.747526  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1943  hypothetical protein  45.45 
 
 		 79 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.153284  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0959  hypothetical protein  44.44 
 
 		 79 aa  49.7  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.134343  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0282  membrane protein  50 
 
 		 64 aa  47  0.00009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5312  hypothetical protein  40.91 
 
 		 71 aa  45.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.50435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4609  hypothetical protein  51.28 
 
 		 103 aa  44.7  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1296  hypothetical protein  37.88 
 
 		 71 aa  43.9  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00854163  normal  0.417956 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6998  hypothetical protein  44.44 
 
 		 92 aa  41.2  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.813818  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3339  hypothetical protein  36.67 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>