36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_3339 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_3339  hypothetical protein  100 
 
 
66 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3174  hypothetical protein  74.24 
 
 
66 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4891  hypothetical protein  53.85 
 
 
67 aa  74.7  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.855496 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4937  hypothetical protein  56.45 
 
 
67 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.185526 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4427  hypothetical protein  53.85 
 
 
67 aa  74.7  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.565322 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3137  hypothetical protein  55 
 
 
70 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0896468  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1296  hypothetical protein  55.93 
 
 
71 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00854163  normal  0.417956 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5312  hypothetical protein  54.24 
 
 
71 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.50435  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2869  hypothetical protein  49.23 
 
 
67 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.134016  normal  0.504721 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0617  hypothetical protein  50.77 
 
 
65 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0761  hypothetical protein  50.77 
 
 
65 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000272187 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0741  hypothetical protein  50.77 
 
 
65 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129654  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4596  hypothetical protein  50.77 
 
 
65 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0411929  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0673  hypothetical protein  49.23 
 
 
65 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0776  hypothetical protein  49.23 
 
 
65 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0617  hypothetical protein  49.23 
 
 
65 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.041251  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0707  hypothetical protein  49.23 
 
 
65 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0835  hypothetical protein  50.79 
 
 
65 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0622  hypothetical protein  49.23 
 
 
65 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0595  hypothetical protein  50.77 
 
 
65 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2952  hypothetical protein  43.55 
 
 
68 aa  57.4  0.00000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1419  hypothetical protein  46.81 
 
 
65 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.279889  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2433  hypothetical protein  35.71 
 
 
77 aa  50.4  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.517963  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2735  hypothetical protein  38.98 
 
 
94 aa  49.3  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0019188  normal  0.0797961 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3190  hypothetical protein  33.85 
 
 
68 aa  47  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6668  hypothetical protein  36.84 
 
 
69 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.297538  normal  0.224588 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0766  YhjC  38.98 
 
 
66 aa  45.1  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3557  hypothetical protein  35.09 
 
 
69 aa  43.9  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.121264  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1446  hypothetical protein  43.4 
 
 
68 aa  43.5  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.55376  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5821  hypothetical protein  41.51 
 
 
65 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0075  hypothetical protein  41.82 
 
 
66 aa  42  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.398237  normal  0.423709 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4361  hypothetical protein  36.84 
 
 
69 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.359787 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3820  hypothetical protein  36.67 
 
 
59 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0432882  normal  0.337677 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3933  hypothetical protein  36.67 
 
 
59 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.174427 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4526  hypothetical protein  34.92 
 
 
65 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.823764 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6400  hypothetical protein  31.75 
 
 
65 aa  40  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.916024  normal  0.116761 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>