24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1419 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_1419  hypothetical protein  100 
 
 
65 aa  125  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.279889  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3174  hypothetical protein  50 
 
 
66 aa  69.3  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5312  hypothetical protein  50.94 
 
 
71 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.50435  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0617  hypothetical protein  49.23 
 
 
65 aa  62.4  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0761  hypothetical protein  49.23 
 
 
65 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000272187 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1296  hypothetical protein  49.06 
 
 
71 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00854163  normal  0.417956 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3339  hypothetical protein  40.62 
 
 
66 aa  60.8  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0673  hypothetical protein  50.88 
 
 
65 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0617  hypothetical protein  50.88 
 
 
65 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.041251  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0707  hypothetical protein  50.88 
 
 
65 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0776  hypothetical protein  49.12 
 
 
65 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0741  hypothetical protein  44.62 
 
 
65 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129654  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3137  hypothetical protein  42.86 
 
 
70 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0896468  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0835  hypothetical protein  49.12 
 
 
65 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4596  hypothetical protein  44.62 
 
 
65 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0411929  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2433  hypothetical protein  33.33 
 
 
77 aa  55.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.517963  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0622  hypothetical protein  45.61 
 
 
65 aa  55.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4891  hypothetical protein  43.08 
 
 
67 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.855496 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4427  hypothetical protein  43.08 
 
 
67 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.565322 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0595  hypothetical protein  44.62 
 
 
65 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2952  hypothetical protein  41.38 
 
 
68 aa  53.1  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4937  hypothetical protein  45.61 
 
 
67 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.185526 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2869  hypothetical protein  39.06 
 
 
67 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.134016  normal  0.504721 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0766  YhjC  40.68 
 
 
66 aa  43.9  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>